MMP16 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/20/Protein_MMP16_PDB_1rm8.png/250px-Protein_MMP16_PDB_1rm8.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | MMP16, C8orf57, MMP-X2, MT-MMP2, MT-MMP3, MT3-MMP, matrix metallopeptidase 16 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602262 MGI: 1276107 HomoloGene: 55939 GeneCards: MMP16 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0010577 enzyme activator activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • zinc ion binding • metalloaminopeptidase activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • GO:0005578 Позаклітинна матриця • клітинна мембрана • extracellular region • cell surface • Golgi lumen • integral component of plasma membrane • міжклітинний простір |
---|
Біологічний процес | • осифікація • extracellular matrix disassembly • осифікація ендохондральна • craniofacial suture morphogenesis • chondrocyte proliferation • collagen catabolic process • embryonic cranial skeleton morphogenesis • bone development • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • протеоліз • protein processing • GO:0044267 protein metabolic process • skeletal system development • extracellular matrix organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c3/PBB_GE_MMP16_208167_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_MMP16_208167_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/39/PBB_GE_MMP16_207012_at_fs.png/250px-PBB_GE_MMP16_207012_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9e/PBB_GE_MMP16_208166_at_fs.png/250px-PBB_GE_MMP16_208166_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_005941 NM_022564 NM_032297 |
| | NM_019724 NM_001379518 NM_001379519 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_062698 NP_001366447 NP_001366448 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 88.03 – 88.33 Mb | Хр. 4: 17.85 – 18.12 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MMP16 (англ. Matrix metallopeptidase 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 607 амінокислот, а молекулярна маса — 69 521[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MILLTFSTGR | | RLDFVHHSGV | | FFLQTLLWIL | | CATVCGTEQY | | FNVEVWLQKY |
GYLPPTDPRM | | SVLRSAETMQ | | SALAAMQQFY | | GINMTGKVDR | | NTIDWMKKPR |
CGVPDQTRGS | | SKFHIRRKRY | | ALTGQKWQHK | | HITYSIKNVT | | PKVGDPETRK |
AIRRAFDVWQ | | NVTPLTFEEV | | PYSELENGKR | | DVDITIIFAS | | GFHGDSSPFD |
GEGGFLAHAY | | FPGPGIGGDT | | HFDSDEPWTL | | GNPNHDGNDL | | FLVAVHELGH |
ALGLEHSNDP | | TAIMAPFYQY | | METDNFKLPN | | DDLQGIQKIY | | GPPDKIPPPT |
RPLPTVPPHR | | SIPPADPRKN | | DRPKPPRPPT | | GRPSYPGAKP | | NICDGNFNTL |
AILRREMFVF | | KDQWFWRVRN | | NRVMDGYPMQ | | ITYFWRGLPP | | SIDAVYENSD |
GNFVFFKGNK | | YWVFKDTTLQ | | PGYPHDLITL | | GSGIPPHGID | | SAIWWEDVGK |
TYFFKGDRYW | | RYSEEMKTMD | | PGYPKPITVW | | KGIPESPQGA | | FVHKENGFTY |
FYKGKEYWKF | | NNQILKVEPG | | YPRSILKDFM | | GCDGPTDRVK | | EGHSPPDDVD |
IVIKLDNTAS | | TVKAIAIVIP | | CILALCLLVL | | VYTVFQFKRK | | GTPRHILYCK |
RSMQEWV |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Takino T., Sato H., Shinagawa A., Seiki M. (1995). Identification of the second membrane-type matrix metalloproteinase (MT-MMP-2) gene from a human placenta cDNA library. MT-MMPs form a unique membrane-type subclass in the MMP family. J. Biol. Chem. 270: 23013—23020. PMID 7559440 DOI:10.1074/jbc.270.39.23013
- Matsumoto S., Katoh M., Saito S., Watanabe T., Masuho Y. (1997). Identification of soluble type of membrane-type matrix metalloproteinase-3 formed by alternatively spliced mRNA. Biochim. Biophys. Acta. 1354: 159—170. PMID 9396633 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00120-6
- Shofuda K., Yasumitsu H., Nishihashi A., Miki K., Miyazaki K. (1997). Expression of three membrane-type matrix metalloproteinases (MT-MMPs) in rat vascular smooth muscle cells and characterization of MT3-MMPs with and without transmembrane domain. J. Biol. Chem. 272: 9749—9754. PMID 9092507 DOI:10.1074/jbc.272.15.9749
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7162 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P51512 (англ.) . Архів оригіналу за 1 червня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM | |
---|
Матриксні металопротеїнази | |
---|
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |