KIF5B |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1BG2, 1MKJ, 2P4N, 3J8X, 3J8Y, 4HNA, 4LNU | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | KIF5B, HEL-S-61, KINH, KNS, KNS1, UKHC, kinesin family member 5B |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602809 MGI: 1098268 HomoloGene: 55829 GeneCards: KIF5B |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
біполярний афективний розлад[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • microtubule motor activity • nucleotide binding • microtubule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • plus-end-directed microtubule motor activity • ATP binding • JUN kinase binding • cadherin binding • microtubule lateral binding • identical protein binding • ATPase activity |
---|
Клітинна компонента | • везикула • мембрана • Кінезин • endocytic vesicle • центр організації мікротрубочок • мембранна органела • ciliary rootlet • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • мікротрубочка • цитоскелет • axonal growth cone • цитоплазма • гіалоплазма • microtubule cytoskeleton • phagocytic vesicle • axon cytoplasm |
---|
Біологічний процес | • cytoskeleton-dependent intracellular transport • plus-end-directed vesicle transport along microtubule • cytoplasm organization • vesicle transport along microtubule • positive regulation of potassium ion transport • regulation of membrane potential • positive regulation of synaptic transmission, GABAergic • axon guidance • microtubule-based movement • stress granule disassembly • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • positive regulation of intracellular protein transport • positive regulation of voltage-gated sodium channel activity • positive regulation of vesicle fusion • centrosome localization • brain development • hippocampus development • positive regulation of protein localization to plasma membrane • cellular response to interferon-gamma • anterograde axonal protein transport • anterograde neuronal dense core vesicle transport • retrograde neuronal dense core vesicle transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 32.01 – 32.06 Mb | Хр. 18: 6.2 – 6.24 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KIF5B (англ. Kinesin family member 5B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 109 685[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADLAECNIK | | VMCRFRPLNE | | SEVNRGDKYI | | AKFQGEDTVV | | IASKPYAFDR |
VFQSSTSQEQ | | VYNDCAKKIV | | KDVLEGYNGT | | IFAYGQTSSG | | KTHTMEGKLH |
DPEGMGIIPR | | IVQDIFNYIY | | SMDENLEFHI | | KVSYFEIYLD | | KIRDLLDVSK |
TNLSVHEDKN | | RVPYVKGCTE | | RFVCSPDEVM | | DTIDEGKSNR | | HVAVTNMNEH |
SSRSHSIFLI | | NVKQENTQTE | | QKLSGKLYLV | | DLAGSEKVSK | | TGAEGAVLDE |
AKNINKSLSA | | LGNVISALAE | | GSTYVPYRDS | | KMTRILQDSL | | GGNCRTTIVI |
CCSPSSYNES | | ETKSTLLFGQ | | RAKTIKNTVC | | VNVELTAEQW | | KKKYEKEKEK |
NKILRNTIQW | | LENELNRWRN | | GETVPIDEQF | | DKEKANLEAF | | TVDKDITLTN |
DKPATAIGVI | | GNFTDAERRK | | CEEEIAKLYK | | QLDDKDEEIN | | QQSQLVEKLK |
TQMLDQEELL | | ASTRRDQDNM | | QAELNRLQAE | | NDASKEEVKE | | VLQALEELAV |
NYDQKSQEVE | | DKTKEYELLS | | DELNQKSATL | | ASIDAELQKL | | KEMTNHQKKR |
AAEMMASLLK | | DLAEIGIAVG | | NNDVKQPEGT | | GMIDEEFTVA | | RLYISKMKSE |
VKTMVKRCKQ | | LESTQTESNK | | KMEENEKELA | | ACQLRISQHE | | AKIKSLTEYL |
QNVEQKKRQL | | EESVDALSEE | | LVQLRAQEKV | | HEMEKEHLNK | | VQTANEVKQA |
VEQQIQSHRE | | THQKQISSLR | | DEVEAKAKLI | | TDLQDQNQKM | | MLEQERLRVE |
HEKLKATDQE | | KSRKLHELTV | | MQDRREQARQ | | DLKGLEETVA | | KELQTLHNLR |
KLFVQDLATR | | VKKSAEIDSD | | DTGGSAAQKQ | | KISFLENNLE | | QLTKVHKQLV |
RDNADLRCEL | | PKLEKRLRAT | | AERVKALESA | | LKEAKENASR | | DRKRYQQEVD |
RIKEAVRSKN | | MARRGHSAQI | | AKPIRPGQHP | | AASPTHPSAI | | RGGGAFVQNS |
QPVAVRGGGG | | KQV |
Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Su Q., Cai Q., Gerwin C., Smith C.L., Sheng Z.-H. (2004). Syntabulin is a microtubule-associated protein implicated in syntaxin transport in neurons. Nat. Cell Biol. 6: 941—953. PMID 15459722 DOI:10.1038/ncb1169
- Boucrot E., Henry T., Borg J.-P., Gorvel J.-P., Meresse S. (2005). The intracellular fate of Salmonella depends on the recruitment of kinesin. Science. 308: 1174—1178. PMID 15905402 DOI:10.1126/science.1110225
- Kull F.J., Sablin E.P., Lau R., Fletterick R.J., Vale R.D. (1996). Crystal structure of the kinesin motor domain reveals a structural similarity to myosin. Nature. 380: 550—555. PMID 8606779 DOI:10.1038/380550a0
- Sindelar C.V., Downing K.H. (2007). The beginning of kinesin's force-generating cycle visualized at 9-A resolution. J. Cell Biol. 177: 377—385. PMID 17470637 DOI:10.1083/jcb.200612090
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з KIF5B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6324 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P33176 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|