MYO18A |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | MYO18A, MYSPDZ, SPR210, myosin XVIIIA, MAJN, SP-R210 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610067 MGI: 2667185 HomoloGene: 7977 GeneCards: MYO18A |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • nucleotide binding • ADP binding • actin filament binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мембрана • trans-Golgi network • actomyosin • цитоскелет • myosin complex • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • cell surface |
---|
Біологічний процес | • Golgi organization • Golgi vesicle budding • actomyosin structure organization • DNA metabolic process • asymmetric Golgi ribbon formation • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of protein secretion • cell migration • Golgi ribbon formation • regulation of macrophage activation • positive regulation of opsonization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001346765 NM_001346766 NM_001346767 NM_001346768 NM_078471
| NM_203318 |
| | NM_001291212 NM_001291213 NM_001291214 NM_001291215 NM_011586 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001333694 NP_001333695 NP_001333696 NP_001333697 NP_510880
| NP_976063 |
| | NP_001278141 NP_001278142 NP_001278143 NP_001278144 NP_035716 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 29.07 – 29.18 Mb | Хр. 11: 77.76 – 77.87 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
MYO18A (англ. Myosin XVIIIA) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 054 амінокислот, а молекулярна маса — 233 115[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFNLMKKDKD | | KDGGRKEKKE | | KKEKKERMSA | | AELRSLEEMS | | LRRGFFNLNR |
SSKRESKTRL | | EISNPIPIKV | | ASGSDLHLTD | | IDSDSNRGSV | | ILDSGHLSTA |
SSSDDLKGEE | | GSFRGSVLQR | | AAKFGSLAKQ | | NSQMIVKRFS | | FSQRSRDESA |
SETSTPSEHS | | AAPSPQVEVR | | TLEGQLVQHP | | GPGIPRPGHR | | SRAPELVTKK |
FPVDLRLPPV | | VPLPPPTLRE | | LELQRRPTGD | | FGFSLRRTTM | | LDRGPEGQAC |
RRVVHFAEPG | | AGTKDLALGL | | VPGDRLVEIN | | GHNVESKSRD | | EIVEMIRQSG |
DSVRLKVQPI | | PELSELSRSW | | LRSGEGPRRE | | PSDAKTEEQI | | AAEEAWNETE |
KVWLVHRDGF | | SLASQLKSEE | | LNLPEGKVRV | | KLDHDGAILD | | VDEDDVEKAN |
APSCDRLEDL | | ASLVYLNESS | | VLHTLRQRYG | | ASLLHTYAGP | | SLLVLGPRGA |
PAVYSEKVMH | | MFKGCRREDM | | APHIYAVAQT | | AYRAMLMSRQ | | DQSIILLGSS |
GSGKTTSCQH | | LVQYLATIAG | | ISGNKVFSVE | | KWQALYTLLE | | AFGNSPTIIN |
GNATRFSQIL | | SLDFDQAGQV | | ASASIQTMLL | | EKLRVARRPA | | SEATFNVFYY |
LLACGDGTLR | | TELHLNHLAE | | NNVFGIVPLA | | KPEEKQKAAQ | | QFSKLQAAMK |
VLGISPDEQK | | ACWFILAAIY | | HLGAAGATKE | | AAEAGRKQFA | | RHEWAQKAAY |
LLGCSLEELS | | SAIFKHQHKG | | GTLQRSTSFR | | QGPEESGLGD | | GTGPKLSALE |
CLEGMAAGLY | | SELFTLLVSL | | VNRALKSSQH | | SLCSMMIVDT | | PGFQNPEQGG |
SARGASFEEL | | CHNYTQDRLQ | | RLFHERTFVQ | | ELERYKEENI | | ELAFDDLEPP |
TDDSVAAVDQ | | ASHQSLVRSL | | ARTDEARGLL | | WLLEEEALVP | | GASEDTLLER |
LFSYYGPQEG | | DKKGQSPLLH | | SSKPHHFLLG | | HSHGTNWVEY | | NVTGWLNYTK |
QNPATQNAPR | | LLQDSQKKII | | SNLFLGRAGS | | ATVLSGSIAG | | LEGGSQLALR |
RATSMRKTFT | | TGMAAVKKKS | | LCIQMKLQVD | | ALIDTIKKSK | | LHFVHCFLPV |
AEGWAGEPRS | | ASSRRVSSSS | | ELDLPSGDHC | | EAGLLQLDVP | | LLRTQLRGSR |
LLDAMRMYRQ | | GYPDHMVFSE | | FRRRFDVLAP | | HLTKKHGRNY | | IVVDERRAVE |
ELLECLDLEK | | SSCCMGLSRV | | FFRAGTLARL | | EEQRDEQTSR | | NLTLFQAACR |
GYLARQHFKK | | RKIQDLAIRC | | VQKNIKKNKG | | VKDWPWWKLF | | TTVRPLIEVQ |
LSEEQIRNKD | | EEIQQLRSKL | | EKAEKERNEL | | RLNSDRLESR | | ISELTSELTD |
ERNTGESASQ | | LLDAETAERL | | RAEKEMKELQ | | TQYDALKKQM | | EVMEMEVMEA |
RLIRAAEING | | EVDDDDAGGE | | WRLKYERAVR | | EVDFTKKRLQ | | QEFEDKLEVE |
QQNKRQLERR | | LGDLQADSEE | | SQRALQQLKK | | KCQRLTAELQ | | DTKLHLEGQQ |
VRNHELEKKQ | | RRFDSELSQA | | HEEAQREKLQ | | REKLQREKDM | | LLAEAFSLKQ |
QLEEKDMDIA | | GFTQKVVSLE | | AELQDISSQE | | SKDEASLAKV | | KKQLRDLEAK |
VKDQEEELDE | | QAGTIQMLEQ | | AKLRLEMEME | | RMRQTHSKEM | | ESRDEEVEEA |
RQSCQKKLKQ | | MEVQLEEEYE | | DKQKVLREKR | | ELEGKLATLS | | DQVNRRDFES |
EKRLRKDLKR | | TKALLADAQL | | MLDHLKNSAP | | SKREIAQLKN | | QLEESEFTCA |
AAVKARKAME | | VEIEDLHLQI | | DDIAKAKTAL | | EEQLSRLQRE | | KNEIQNRLEE |
DQEDMNELMK | | KHKAAVAQAS | | RDLAQINDLQ | | AQLEEANKEK | | QELQEKLQAL |
QSQVEFLEQS | | MVDKSLVSRQ | | EAKIRELETR | | LEFERTQVKR | | LESLASRLKE |
NMEKLTEERD | | QRIAAENREK | | EQNKRLQRQL | | RDTKEEMGEL | | ARKEAEASRK |
KHELEMDLES | | LEAANQSLQA | | DLKLAFKRIG | | DLQAAIEDEM | | ESDENEDLIN |
SLQDMVTKYQ | | KRKNKLEGDS | | DVDSELEDRV | | DGVKSWLSKN | | KGPSKAASDD |
GSLKSSSPTS | | YWKSLAPDRS | | DDEHDPLDNT | | SRPRYSHSYL | | SDSDTEAKLT |
ETNA |
Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, міозинів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, апараті гольджі.
Література
- Homma K., Kikuno R.F., Nagase T., Ohara O., Nishikawa K. (2004). Alternative splice variants encoding unstable protein domains exist in the human brain. J. Mol. Biol. 343: 1207—1220. PMID 15491607 DOI:10.1016/j.jmb.2004.09.028
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tan I., Yong J., Dong J.M., Lim L., Leung T. (2008). A tripartite complex containing MRCK modulates lamellar actomyosin retrograde flow. Cell. 135: 123—136. PMID 18854160 DOI:10.1016/j.cell.2008.09.018
- Ng M.M., Dippold H.C., Buschman M.D., Noakes C.J., Field S.J. (2013). GOLPH3L antagonizes GOLPH3 to determine Golgi morphology. Mol. Biol. Cell. 24: 796—808. PMID 23345592 DOI:10.1091/mbc.E12-07-0525
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:31104 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q92614 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|