CLEC4A |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
5B1W, 5B1X |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | CLEC4A, CLECSF6, DCIR, DDB27, LLIR, CD367, HDCGC13P, C-type lectin domain family 4 member A, hDCIR |
---|
Внешние ID | OMIM: 605306 MGI: 1349412 HomoloGene: 49291 GeneCards: CLEC4A |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![6-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c0/Ideogram_house_mouse_chromosome_6.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_6.svg.png) | Хр. | 6-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 6 F2|6 58.18 cM | Начало | 123,083,387 bp[2] |
---|
Конец | 123,120,958 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
| Наибольшая экспрессия в | - stroma of bone marrow
- tibiofemoral joint
- seminiferous tubule
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/1f/PBB_GE_CLEC4A_219947_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLEC4A_219947_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bc/PBB_GE_CLEC4A_221724_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_CLEC4A_221724_s_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - transmembrane signaling receptor activity
- связывание углеводов
- calcium ion binding
- mannose binding
- связывание с ионом металла
| Компонент клетки | - часть мембраны
- клеточная мембрана
- часть клеточной мембраны
- мембрана
| Биологический процесс | - cell surface receptor signaling pathway
- агрегация клеток
- stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway
- adaptive immune response
- immune system process
- врождённый иммунитет
- negative regulation of cytokine production
- plasmacytoid dendritic cell antigen processing and presentation
- negative regulation of tumor necrosis factor production
- CD8-positive, alpha-beta T cell activation
- antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | |
---|
NM_016184 NM_194447 NM_194448 NM_194450 |
| |
---|
NM_001170332 NM_001170333 NM_011999 |
|
---|
RefSeq (белок) | |
---|
NP_057268 NP_919429 NP_919430 NP_919432 |
| |
---|
NP_001163803 NP_001163804 NP_036129 |
|
---|
Локус (UCSC) | Chr 12: 8.12 – 8.14 Mb | Chr 6: 123.08 – 123.12 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
CLEC4A (англ. C-type lectin domain family 4 member A, лектин С-типа домен семейство 4 член A; CD367) — мембранный белок, рецептор семейства лектинов типа С. Продукт гена человека CLEC4A[5][6].
Структура
CLEC7A состоит из 237 аминокислот, молекулярная масса 27,5 кДа. Содержит лектиновый домен типа C и ингибирующий ITIM-подобный мотив.
Функции
CLEC4A является мембранным белком 2-го типа из семейства лектинов типа С. Этот рецептор опознавания паттерна связывает углеводы маннозу и фукозу и с меньшей афинностью N-ацетилглюкозамин в Ca2+-зависимой манере. Регулирует иммунную реактивность. После связывания антигена рецептор CLEC4A интернализуется в ходе клатрин-зависимого эндоцитоза и доставляет антиген в антиген-представляющий путь, что приводит к презентации антигена CD8+ T-лимфоцитам. Презентация и активация CD8+ T-клеток усиливается агонистами рецепторов TLR7 и TLR8.
Через ITAM-мотив может также участвовать в ингибировании мобилизации кальция, опосредованной B-клеточным рецептором, и фосфорилирования.
Играет роль во взаимодействии вируса HIV-1 и дендритных клеток. Повышает связывание вируса с клеткой, его проникновение и инфицирование.
Тканевая специфичность
Белок экспрессирован в основном на гематопоэтических клетках: на всех циркулирующих антиген-представляющих клетках, включая дендритные клетки, миелоидные клетки, моноциты, макрофагы, B-лимфоциты и эпидермальных клетках Лангерганса. Кроме этого, экспрессирован на лейкоцитах, нейтрофилах периферической крови, в меньше степени - в селезёнке, лимфатических узлах и костном мозге.
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000111729 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030148 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Bates E.E., Fournier N., Garcia E., Valladeau J., Durand I., Pin J.J., Zurawski S.M., Patel S., Abrams J.S., Lebecque S., Garrone P., Saeland S. APCs express DCIR, a novel C-type lectin surface receptor containing an immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif (англ.) // J Immunol[англ.] : journal. — 1999. — September (vol. 163, no. 4). — P. 1973—1983. — PMID 10438934.
- ↑ Entrez Gene: CLEC4A C-type lectin domain family 4, member A (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
Литература
- Drickamer K. C-type lectin-like domains. (англ.) // Curr. Opin. Struct. Biol.. — 1999. — Vol. 9, no. 5. — P. 585—590. — doi:10.1016/S0959-440X(99)00009-3. — PMID 10508765.
- Huang X., Yuan Z., Chen G. et al. Cloning and characterization of a novel ITIM containing lectin-like immunoreceptor LLIR and its two transmembrane region deletion variants. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 281, no. 1. — P. 131—140. — doi:10.1006/bbrc.2001.4322. — PMID 11178971.
- Richard M., Veilleux P., Rouleau M. et al. The expression pattern of the ITIM-bearing lectin CLECSF6 in neutrophils suggests a key role in the control of inflammation. (англ.) // J. Leukoc. Biol.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 71, no. 5. — P. 871—880. — PMID 11994513.
- Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Ebner S., Sharon N., Ben-Tal N. Evolutionary analysis reveals collective properties and specificity in the C-type lectin and lectin-like domain superfamily. (англ.) // Proteins : journal. — 2003. — Vol. 53, no. 1. — P. 44—55. — doi:10.1002/prot.10440. — PMID 12945048.
- Richard M., Thibault N., Veilleux P. et al. The ITIM-bearing CLECSF6 (DCIR) is down-modulated in neutrophils by neutrophil activating agents. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 310, no. 3. — P. 767—773. — doi:10.1016/j.bbrc.2003.09.077. — PMID 14550269.
- Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A. et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
- Richard M., Thibault N., Veilleux P. et al. Granulocyte macrophage-colony stimulating factor reduces the affinity of SHP-2 for the ITIM of CLECSF6 in neutrophils: a new mechanism of action for SHP-2. (англ.) // Mol. Immunol.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 43, no. 10. — P. 1716—1721. — doi:10.1016/j.molimm.2005.10.006. — PMID 16360206.
- Lorentzen J.C., Flornes L., Eklöw C. et al. Association of arthritis with a gene complex encoding C-type lectin-like receptors. (англ.) // Arthritis Rheum.[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 56, no. 8. — P. 2620—2632. — doi:10.1002/art.22813. — PMID 17665455.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|