IL10RB |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортологов: PDBe RCSB |
---|
Список идентификаторов PDB |
---|
3LQM |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | IL10RB, CDW210B, CRF2-4, CRFB4, D21S58, D21S66, IL-10R2, Interleukin 10 receptor, beta subunit, interleukin 10 receptor subunit beta |
---|
Внешние ID | OMIM: 123889 MGI: 109380 HomoloGene: 523 GeneCards: IL10RB |
---|
|
Расположение гена (Мышь) |
---|
![16-я хромосома мыши](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/28/Ideogram_house_mouse_chromosome_16.svg/260px-Ideogram_house_mouse_chromosome_16.svg.png) | Хр. | 16-я хромосома мыши[2] |
---|
| Локус | 16 C3.3|16 52.87 cM | Начало | 91,203,052 bp[2] |
---|
Конец | 91,222,722 bp[2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
Bgee | Человек | Мышь (ортолог) |
---|
Наибольшая экспрессия в | - mucosa of transverse colon
|
| Наибольшая экспрессия в | - Ileal epithelium
- cardiac muscle tissue of left ventricle
- stroma of bone marrow
- interventricular septum
- right lung lobe
- choroid plexus of fourth ventricle
- lumbar spinal ganglion
|
| Дополнительные справочные данные |
|
---|
BioGPS | ![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8a/PBB_GE_IL10RB_209575_at_fs.png/250px-PBB_GE_IL10RB_209575_at_fs.png) | Дополнительные справочные данные |
|
---|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | - связывание с белками плазмы
- interleukin-10 receptor activity
- signaling receptor activity
- cytokine receptor activity
| Компонент клетки | - часть мембраны
- interleukin-28 receptor complex
- мембрана
- клеточная мембрана
| Биологический процесс | - воспалительная реакция
- defense response to virus
- иммунный ответ
- передача сигнала
- cytokine-mediated signaling pathway
- positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT
| Источники: Amigo, QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Вид | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Chr 21: 33.27 – 33.31 Mb | Chr 16: 91.2 – 91.22 Mb |
---|
Поиск по PubMed | Искать[3] | Искать[4] |
---|
|
Информация в Викиданных |
Смотреть (человек) | Смотреть (мышь) |
|
Рецептор интерлейкина 10, бета-субъединица (англ. Interleukin 10 receptor, beta subunit, IL10Rβ, IL10RB) — белок, субъединица рецептора интерлейкина 10, продукт гена человека IL10RB[5].
Функции
Белок принадлежит к семейству цитокиновых рецепторов. IL10RB является вспомогательной субъединицей тетрамерного комплекса рецептора интерлейкина 10. Для индуцирования переноса сигнала интерлейкина 10 необходима экспрессия как α-, так и β-субъединицы. Этот ген и три гена интерфероновых рецепторов IFNAR2, IFNAR1 и IFNGR2 образуют класс II цитокиновых рецепторов, которые локализуются на 21-й хромосоме человека[5].
Играет роль в активации пяти цитокинов 2-го класса: IL10, IL22, IL26, IL28 и IFNL1. Димер IFNLR1/IL10RB является рецептором цитокиновых лигандов IFNL2 и IFNL3 и опосредует их антивирусную активность. Лиганд-рецепторный комплекс стимулирует активацию сигнального пути JAK/STAT, который приводит к экспрессии интерферон-стимулируемых генов, координирующих антивирусный ответ организма[6][7].
Структура
Белок состоит из 325 аминокислот, молекулярная масса 37 кДа. Имеет 4 N-гликозилированных аспарагиновых остатка и 2 дисульфидные связи. Цитокиновый рецептор IL10R является гетеротетрамером, который состоит из двух α-цепей (IL10Rα, или IL10R1) и двух β-цепей (IL10Rβ, или IL10R2)[7].
Примечания
- ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000243646 - Ensembl, May 2017
- ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022969 - Ensembl, May 2017
- ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ↑ 1 2 Entrez Gene: IL10RB interleukin 10 receptor, beta (неопр.).
- ↑ Sheppard P., Kindsvogel W., Xu W., Henderson K., Schlutsmeyer S., Whitmore T. E. et al. IL-28, IL-29 and their class II cytokine receptor IL-28R (англ.) // Nat Immunol : journal. — 2003. — Vol. 4, no. 1. — P. 63—8. — doi:10.1038/ni873. — PMID 12469119.
- ↑ 1 2 Donnelly R. P., Sheikh F., Kotenko S. V., Dickensheets H. The expanded family of class II cytokines that share the IL-10 receptor-2 (IL-10R2) chain (англ.) // J Leukoc Biol[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 76, no. 2. — P. 314—321. — doi:10.1189/jlb.0204117. — PMID 15123776.
Литература
- Lutfalla G., McInnis M. G., Antonarakis S. E., Uzé G. Structure of the human CRFB4 gene: comparison with its IFNAR neighbor (англ.) // J. Mol. Evol.[англ.] : journal. — 1995. — Vol. 41, no. 3. — P. 338—344. — doi:10.1007/BF01215180. — PMID 7563119.
- Lutfalla G., Gardiner K., Uzé G. A new member of the cytokine receptor gene family maps on chromosome 21 at less than 35 kb from IFNAR (англ.) // Genomics : journal. — 1993. — Vol. 16, no. 2. — P. 366—373. — doi:10.1006/geno.1993.1199. — PMID 8314576.
- Gibbs V. C., Pennica D. CRF2-4: isolation of cDNA clones encoding the human and mouse proteins (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 186, no. 1. — P. 97—101. — doi:10.1016/S0378-1119(96)00690-7. — PMID 9047351.
- Kotenko S. V., Krause C. D., Izotova L. S., etal. Identification and functional characterization of a second chain of the interleukin-10 receptor complex (англ.) // EMBO J. : journal. — 1997. — Vol. 16, no. 19. — P. 5894—5903. — doi:10.1093/emboj/16.19.5894. — PMID 9312047. — PMC 1170220.
- Spencer S. D., Di Marco F., Hooley J., etal. The orphan receptor CRF2-4 is an essential subunit of the interleukin 10 receptor (англ.) // J. Exp. Med.[англ.] : journal. — Rockefeller University Press[англ.], 1998. — Vol. 187, no. 4. — P. 571—578. — doi:10.1084/jem.187.4.571. — PMID 9463407. — PMC 2212143.
- Reboul J., Gardiner K., Monneron D., etal. Comparative genomic analysis of the interferon/interleukin-10 receptor gene cluster (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 9, no. 3. — P. 242—250. — doi:10.1101/gr.9.3.242. — PMID 10077530. — PMC 310731.
- Hattori M., Fujiyama A., Taylor T. D., etal. The DNA sequence of human chromosome 21 (англ.) // Nature. — 2000. — Vol. 405, no. 6784. — P. 311—319. — doi:10.1038/35012518. — PMID 10830953.
- Xie M. H., Aggarwal S., Ho W. H., etal. Interleukin (IL)-22, a novel human cytokine that signals through the interferon receptor-related proteins CRF2-4 and IL-22R (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 40. — P. 31335—31339. — doi:10.1074/jbc.M005304200. — PMID 10875937.
- Dumoutier L., Van Roost E., Colau D., Renauld J. C. Human interleukin-10-related T cell-derived inducible factor: molecular cloning and functional characterization as an hepatocyte-stimulating factor (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2000. — Vol. 97, no. 18. — P. 10144—10149. — doi:10.1073/pnas.170291697. — PMID 10954742. — PMC 27764.
- Lewis K., Li C., Perrin M. H., etal. Identification of urocortin III, an additional member of the corticotropin-releasing factor (CRF) family with high affinity for the CRF2 receptor (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — Vol. 98, no. 13. — P. 7570—7575. — doi:10.1073/pnas.121165198. — PMID 11416224. — PMC 34709.
- Hollborn M., Kohen L., Wiedemann P., Enzmann V. The influence of pro-inflammatory cytokines on human retinal pigment epithelium cell receptors (англ.) // Graefes Arch. Clin. Exp. Ophthalmol. : journal. — 2001. — Vol. 239, no. 4. — P. 294—301. — doi:10.1007/s004170100263. — PMID 11450494.
- Josephson K., Logsdon N. J., Walter M. R. Crystal structure of the IL-10/IL-10R1 complex reveals a shared receptor binding site (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press, 2001. — Vol. 15, no. 1. — P. 35—46. — doi:10.1016/S1074-7613(01)00169-8. — PMID 11485736.
- Sheppard P., Kindsvogel W., Xu W., etal. IL-28, IL-29 and their class II cytokine receptor IL-28R (англ.) // Nat. Immunol. : journal. — 2003. — Vol. 4, no. 1. — P. 63—8. — doi:10.1038/ni873. — PMID 12469119.
- Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Kotenko S. V., Gallagher G., Baurin V. V., etal. IFN-lambdas mediate antiviral protection through a distinct class II cytokine receptor complex (англ.) // Nat. Immunol. : journal. — 2003. — Vol. 4, no. 1. — P. 69—77. — doi:10.1038/ni875. — PMID 12483210.
- Hör S., Pirzer H., Dumoutier L., etal. The T-cell lymphokine interleukin-26 targets epithelial cells through the interleukin-20 receptor 1 and interleukin-10 receptor 2 chains (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 32. — P. 33343—33351. — doi:10.1074/jbc.M405000200. — PMID 15178681.
- Zhang Z., Henzel W. J. Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites (англ.) // Protein Sci.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 13, no. 10. — P. 2819—2824. — doi:10.1110/ps.04682504. — PMID 15340161. — PMC 2286551.
- Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
- Pletnev S., Magracheva E., Wlodawer A., Zdanov A. A model of the ternary complex of interleukin-10 with its soluble receptors (англ.) // BMC Struct. Biol.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 5. — P. 10. — doi:10.1186/1472-6807-5-10. — PMID 15985167. — PMC 1192808.
- Kimura K., Wakamatsu A., Suzuki Y., etal. Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 1. — P. 55—65. — doi:10.1101/gr.4039406. — PMID 16344560. — PMC 1356129.
![Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c9/Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg/14px-Wikipedia_interwiki_section_gear_icon.svg.png) |
---|
1-50 | - CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E)
- CD2
- CD3 (γ, δ, ε)
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 (a)
- CD9
- CD10
- CD11 (a, b, c, d)
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 (A, B)
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 (A, B)
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 (a, b, c, d)
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 (a, b, c, d, e, f)
- CD50
|
---|
51-100 | - CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 (E, L, P)
- CD63
- CD64 (A, B, C)
- CD66 (a, b, c, d, e, f)
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 (a, b)
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 (a, d, e, h, j, k)
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 | |
---|
151-200 | - CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 (a, b, c)
- CD157
- CD158 (a, d, e, i, k)
- CD159 (a, c)
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 (a, b)
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 (a, b, g)
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 (a, b)
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|
351-400 | |
---|