CDH5 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CDH5, 7B4, CD144, VE-cadherin, cadherin 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601120 MGI: 105057 HomoloGene: 1359 GeneCards: CDH5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • beta-catenin binding • transmembrane transporter binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein phosphatase binding • signaling receptor binding • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding • vascular endothelial growth factor receptor 2 binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • cell-cell junction • bicellular tight junction • Адгезивні контакти • cell surface • міжклітинні контакти • external side of plasma membrane • cell periphery • клітинна мембрана • catenin complex |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of establishment of endothelial barrier • адгезія клітин • cell-cell junction assembly • adherens junction organization • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • regulation of establishment of cell polarity • negative regulation of cell population proliferation • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • blood vessel maturation • cell-cell adhesion • negative regulation of inflammatory response • positive regulation of angiogenesis • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • GO:0000767 cell morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/71/PBB_GE_CDH5_204677_at_fs.png/250px-PBB_GE_CDH5_204677_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 66.37 – 66.4 Mb | Хр. 8: 104.83 – 104.87 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CDH5 (англ. Cadherin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 784 амінокислот, а молекулярна маса — 87 528[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MQRLMMLLAT | | SGACLGLLAV | | AAVAAAGANP | | AQRDTHSLLP | | THRRQKRDWI |
WNQMHIDEEK | | NTSLPHHVGK | | IKSSVSRKNA | | KYLLKGEYVG | | KVFRVDAETG |
DVFAIERLDR | | ENISEYHLTA | | VIVDKDTGEN | | LETPSSFTIK | | VHDVNDNWPV |
FTHRLFNASV | | PESSAVGTSV | | ISVTAVDADD | | PTVGDHASVM | | YQILKGKEYF |
AIDNSGRIIT | | ITKSLDREKQ | | ARYEIVVEAR | | DAQGLRGDSG | | TATVLVTLQD |
INDNFPFFTQ | | TKYTFVVPED | | TRVGTSVGSL | | FVEDPDEPQN | | RMTKYSILRG |
DYQDAFTIET | | NPAHNEGIIK | | PMKPLDYEYI | | QQYSFIVEAT | | DPTIDLRYMS |
PPAGNRAQVI | | INITDVDEPP | | IFQQPFYHFQ | | LKENQKKPLI | | GTVLAMDPDA |
ARHSIGYSIR | | RTSDKGQFFR | | VTKKGDIYNE | | KELDREVYPW | | YNLTVEAKEL |
DSTGTPTGKE | | SIVQVHIEVL | | DENDNAPEFA | | KPYQPKVCEN | | AVHGQLVLQI |
SAIDKDITPR | | NVKFKFILNT | | ENNFTLTDNH | | DNTANITVKY | | GQFDREHTKV |
HFLPVVISDN | | GMPSRTGTST | | LTVAVCKCNE | | QGEFTFCEDM | | AAQVGVSIQA |
VVAILLCILT | | ITVITLLIFL | | RRRLRKQARA | | HGKSVPEIHE | | QLVTYDEEGG |
GEMDTTSYDV | | SVLNSVRRGG | | AKPPRPALDA | | RPSLYAQVQK | | PPRHAPGAHG |
GPGEMAAMIE | | VKKDEADHDG | | DGPPYDTLHI | | YGYEGSESIA | | ESLSSLGTDS |
SDSDVDYDFL | | NDWGPRFKML | | AELYGSDPRE | | ELLY |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.
Література
- Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 DOI:10.1042/0264-6021:3490159
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ali J., Liao F., Martens E., Muller W.A. (1997). Vascular endothelial cadherin (VE-cadherin): cloning and role in endothelial cell-cell adhesion. Microcirculation. 4: 267—277. PMID 9219219
- Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1764 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P33151 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|