PTPRJ |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/92/Protein_PTPRJ_PDB_2cfv.png/250px-Protein_PTPRJ_PDB_2cfv.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2CFV, 2DLE, 2NZ6 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PTPRJ, CD148, DEP1, HPTPeta, R-PTP-ETA, SCC1, protein tyrosine phosphatase, receptor type J, protein tyrosine phosphatase receptor type J, R-PTP-J, HPTP eta |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600925 MGI: 104574 HomoloGene: 2130 GeneCards: PTPRJ |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
lymphoblastic leukemia[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • beta-catenin binding • phosphoprotein phosphatase activity • gamma-catenin binding • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • delta-catenin binding • mitogen-activated protein kinase binding • platelet-derived growth factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • protein kinase binding • protein tyrosine phosphatase activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • cell projection • мембрана • cell-cell junction • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • ruffle membrane • cell surface • міжклітинні контакти • immunological synapse • екзосома • specific granule membrane |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of platelet-derived growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of protein kinase B signaling • positive regulation of protein kinase B signaling • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • GO:0016576 protein dephosphorylation • contact inhibition • negative regulation of T cell receptor signaling pathway • regulation of cell adhesion • negative regulation of cell migration • negative regulation of MAP kinase activity • negative regulation of cell growth • positive regulation of focal adhesion assembly • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway • positive chemotaxis • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of vascular permeability • positive regulation of cell adhesion • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • neutrophil degranulation • B cell differentiation • positive regulation of tumor necrosis factor production • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source • positive regulation of MAPK cascade • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • positive regulation of Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/57/PBB_GE_PTPRJ_210173_at_fs.png/250px-PBB_GE_PTPRJ_210173_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 11: 47.98 – 48.17 Mb | Хр. 2: 90.26 – 90.41 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PTPRJ (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type J) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 337 амінокислот, а молекулярна маса — 145 941[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKPAAREARL | | PPRSPGLRWA | | LPLLLLLLRL | | GQILCAGGTP | | SPIPDPSVAT |
VATGENGITQ | | ISSTAESFHK | | QNGTGTPQVE | | TNTSEDGESS | | GANDSLRTPE |
QGSNGTDGAS | | QKTPSSTGPS | | PVFDIKAVSI | | SPTNVILTWK | | SNDTAASEYK |
YVVKHKMENE | | KTITVVHQPW | | CNITGLRPAT | | SYVFSITPGI | | GNETWGDPRV |
IKVITEPIPV | | SDLRVALTGV | | RKAALSWSNG | | NGTASCRVLL | | ESIGSHEELT |
QDSRLQVNIS | | GLKPGVQYNI | | NPYLLQSNKT | | KGDPLGTEGG | | LDASNTERSR |
AGSPTAPVHD | | ESLVGPVDPS | | SGQQSRDTEV | | LLVGLEPGTR | | YNATVYSQAA |
NGTEGQPQAI | | EFRTNAIQVF | | DVTAVNISAT | | SLTLIWKVSD | | NESSSNYTYK |
IHVAGETDSS | | NLNVSEPRAV | | IPGLRSSTFY | | NITVCPVLGD | | IEGTPGFLQV |
HTPPVPVSDF | | RVTVVSTTEI | | GLAWSSHDAE | | SFQMHITQEG | | AGNSRVEITT |
NQSIIIGGLF | | PGTKYCFEIV | | PKGPNGTEGA | | SRTVCNRTVP | | SAVFDIHVVY |
VTTTEMWLDW | | KSPDGASEYV | | YHLVIESKHG | | SNHTSTYDKA | | ITLQGLIPGT |
LYNITISPEV | | DHVWGDPNST | | AQYTRPSNVS | | NIDVSTNTTA | | ATLSWQNFDD |
ASPTYSYCLL | | IEKAGNSSNA | | TQVVTDIGIT | | DATVTELIPG | | SSYTVEIFAQ |
VGDGIKSLEP | | GRKSFCTDPA | | SMASFDCEVV | | PKEPALVLKW | | TCPPGANAGF |
ELEVSSGAWN | | NATHLESCSS | | ENGTEYRTEV | | TYLNFSTSYN | | ISITTVSCGK |
MAAPTRNTCT | | TGITDPPPPD | | GSPNITSVSH | | NSVKVKFSGF | | EASHGPIKAY |
AVILTTGEAG | | HPSADVLKYT | | YEDFKKGASD | | TYVTYLIRTE | | EKGRSQSLSE |
VLKYEIDVGN | | ESTTLGYYNG | | KLEPLGSYRA | | CVAGFTNITF | | HPQNKGLIDG |
AESYVSFSRY | | SDAVSLPQDP | | GVICGAVFGC | | IFGALVIVTV | | GGFIFWRKKR |
KDAKNNEVSF | | SQIKPKKSKL | | IRVENFEAYF | | KKQQADSNCG | | FAEEYEDLKL |
VGISQPKYAA | | ELAENRGKNR | | YNNVLPYDIS | | RVKLSVQTHS | | TDDYINANYM |
PGYHSKKDFI | | ATQGPLPNTL | | KDFWRMVWEK | | NVYAIIMLTK | | CVEQGRTKCE |
EYWPSKQAQD | | YGDITVAMTS | | EIVLPEWTIR | | DFTVKNIQTS | | ESHPLRQFHF |
TSWPDHGVPD | | TTDLLINFRY | | LVRDYMKQSP | | PESPILVHCS | | AGVGRTGTFI |
AIDRLIYQIE | | NENTVDVYGI | | VYDLRMHRPL | | MVQTEDQYVF | | LNQCVLDIVR |
SQKDSKVDLI | | YQNTTAMTIY | | ENLAPVTTFG | | KTNGYIA |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.
Література
- Oestman A., Yang Q., Tonks N.K. (1994). Expression of DEP-1, a receptor-like protein-tyrosine-phosphatase, is enhanced with increasing cell density. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 9680—9684. PMID 7937872 DOI:10.1073/pnas.91.21.9680
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Baker J.E., Majeti R., Tangye S.G., Weiss A. (2001). Protein tyrosine phosphatase CD148-mediated inhibition of T-cell receptor signal transduction is associated with reduced LAT and phospholipase Cgamma1 phosphorylation. Mol. Cell. Biol. 21: 2393—2403. PMID 11259588 DOI:10.1128/MCB.21.7.2393-2403.2001
- Persson C., Engstrom U., Mowbray S.L., Ostman A. (2002). Primary sequence determinants responsible for site-selective dephosphorylation of the PDGF beta-receptor by the receptor-like protein tyrosine phosphatase DEP-1. FEBS Lett. 517: 27—31. PMID 12062403 DOI:10.1016/S0014-5793(02)02570-X
- Holsinger L.J., Ward K., Duffield B., Zachwieja J., Jallal B. (2002). The transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase DEP1 interacts with p120(ctn). Oncogene. 21: 7067—7076. PMID 12370829 DOI:10.1038/sj.onc.1205858
- Palka H.L., Park M., Tonks N.K. (2003). Hepatocyte growth factor receptor tyrosine kinase met is a substrate of the receptor protein-tyrosine phosphatase DEP-1. J. Biol. Chem. 278: 5728—5735. PMID 12475979 DOI:10.1074/jbc.M210656200
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PTPRJ переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9673 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q12913 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|