ITGAX |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2b/Protein_ITGAX_PDB_1n3y.png/250px-Protein_ITGAX_PDB_1n3y.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1N3Y, 2LUV, 3K6S, 3K71, 3K72, 4NEH, 4NEN, 5ES4 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ITGAX, CD11C, SLEB6, integrin subunit alpha X |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 151510 MGI: 96609 HomoloGene: 55493 GeneCards: ITGAX |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • cell surface • integrin complex • клітинна мембрана • мембрана • secretory granule membrane • tertiary granule membrane • ficolin-1-rich granule membrane |
---|
Біологічний процес | • animal organ morphogenesis • integrin-mediated signaling pathway • heterotypic cell-cell adhesion • адгезія клітин • extracellular matrix organization • leukocyte migration • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • neutrophil degranulation • cytokine-mediated signaling pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4b/PBB_GE_ITGAX_210184_at_fs.png/250px-PBB_GE_ITGAX_210184_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_021334 NM_001363984 NM_001363985 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_067309 NP_001350913 NP_001350914 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 31.36 – 31.38 Mb | Хр. 7: 127.73 – 127.75 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ITGAX (англ. Integrin subunit alpha X) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 163 амінокислот, а молекулярна маса — 127 829[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTRTRAALLL | | FTALATSLGF | | NLDTEELTAF | | RVDSAGFGDS | | VVQYANSWVV |
VGAPQKITAA | | NQTGGLYQCG | | YSTGACEPIG | | LQVPPEAVNM | | SLGLSLASTT |
SPSQLLACGP | | TVHHECGRNM | | YLTGLCFLLG | | PTQLTQRLPV | | SRQECPRQEQ |
DIVFLIDGSG | | SISSRNFATM | | MNFVRAVISQ | | FQRPSTQFSL | | MQFSNKFQTH |
FTFEEFRRSS | | NPLSLLASVH | | QLQGFTYTAT | | AIQNVVHRLF | | HASYGARRDA |
AKILIVITDG | | KKEGDSLDYK | | DVIPMADAAG | | IIRYAIGVGL | | AFQNRNSWKE |
LNDIASKPSQ | | EHIFKVEDFD | | ALKDIQNQLK | | EKIFAIEGTE | | TTSSSSFELE |
MAQEGFSAVF | | TPDGPVLGAV | | GSFTWSGGAF | | LYPPNMSPTF | | INMSQENVDM |
RDSYLGYSTE | | LALWKGVQSL | | VLGAPRYQHT | | GKAVIFTQVS | | RQWRMKAEVT |
GTQIGSYFGA | | SLCSVDVDSD | | GSTDLVLIGA | | PHYYEQTRGG | | QVSVCPLPRG |
WRRWWCDAVL | | YGEQGHPWGR | | FGAALTVLGD | | VNGDKLTDVV | | IGAPGEEENR |
GAVYLFHGVL | | GPSISPSHSQ | | RIAGSQLSSR | | LQYFGQALSG | | GQDLTQDGLV |
DLAVGARGQV | | LLLRTRPVLW | | VGVSMQFIPA | | EIPRSAFECR | | EQVVSEQTLV |
QSNICLYIDK | | RSKNLLGSRD | | LQSSVTLDLA | | LDPGRLSPRA | | TFQETKNRSL |
SRVRVLGLKA | | HCENFNLLLP | | SCVEDSVTPI | | TLRLNFTLVG | | KPLLAFRNLR |
PMLAADAQRY | | FTASLPFEKN | | CGADHICQDN | | LGISFSFPGL | | KSLLVGSNLE |
LNAEVMVWND | | GEDSYGTTIT | | FSHPAGLSYR | | YVAEGQKQGQ | | LRSLHLTCDS |
APVGSQGTWS | | TSCRINHLIF | | RGGAQITFLA | | TFDVSPKAVL | | GDRLLLTANV |
SSENNTPRTS | | KTTFQLELPV | | KYAVYTVVSS | | HEQFTKYLNF | | SESEEKESHV |
AMHRYQVNNL | | GQRDLPVSIN | | FWVPVELNQE | | AVWMDVEVSH | | PQNPSLRCSS |
EKIAPPASDF | | LAHIQKNPVL | | DCSIAGCLRF | | RCDVPSFSVQ | | EELDFTLKGN |
LSFGWVRQIL | | QKKVSVVSVA | | EITFDTSVYS | | QLPGQEAFMR | | AQTTTVLEKY |
KVHNPTPLIV | | GSSIGGLLLL | | ALITAVLYKV | | GFFKRQYKEM | | MEEANGQIAP |
ENGTQTPSPP | | SEK |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chua G.L., Tang X.Y., Patra A.T., Tan S.M., Bhattacharjya S. (2012). Structure and binding interface of the cytosolic tails of alphaXbeta2 integrin. PLoS ONE. 7: E41924—E41924. PMID 22844534 DOI:10.1371/journal.pone.0041924
- Corbi A.L., Miller L.J., O'Connor K., Larson R.S., Springer T.A. (1987). cDNA cloning and complete primary structure of the alpha subunit of a leukocyte adhesion glycoprotein, p150,95. EMBO J. 6: 4023—4028. PMID 3327687
- Corbi A.L., Garcia-Aguilar J., Springer T.A. (1990). Genomic structure of an integrin alpha subunit, the leukocyte p150,95 molecule. J. Biol. Chem. 265: 2782—2788. PMID 2303426
- Miller L.J., Wiebe M., Springer T.A. (1987). Purification and alpha subunit N-terminal sequences of human Mac-1 and p150,95 leukocyte adhesion proteins. J. Immunol. 138: 2381—2383. PMID 3549901
- Corbi A.L., Garcia-Aguilar J., Springer T.A. (1990). J. Biol. Chem. 265: 12750—12751.
{{cite journal}}
: Пропущений або порожній |title=
(довідка)
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6152 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P20702 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|