ITGA6
ITGA6 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ITGA6, CD49f, ITGA6B, VLA-6, integrin subunit alpha 6, JEB6 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 147556 MGI: 96605 HomoloGene: 20091 GeneCards: ITGA6 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
рак простати[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 172.43 – 172.51 Mb | Хр. 2: 71.58 – 71.69 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
ITGA6 (англ. Integrin subunit alpha 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 130 амінокислот, а молекулярна маса — 126 606[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAAAGQLCLL | YLSAGLLSRL | GAAFNLDTRE | DNVIRKYGDP | GSLFGFSLAM | ||||
HWQLQPEDKR | LLLVGAPRAE | ALPLQRANRT | GGLYSCDITA | RGPCTRIEFD | ||||
NDADPTSESK | EDQWMGVTVQ | SQGPGGKVVT | CAHRYEKRQH | VNTKQESRDI | ||||
FGRCYVLSQN | LRIEDDMDGG | DWSFCDGRLR | GHEKFGSCQQ | GVAATFTKDF | ||||
HYIVFGAPGT | YNWKGIVRVE | QKNNTFFDMN | IFEDGPYEVG | GETEHDESLV | ||||
PVPANSYLGL | LFLTSVSYTD | PDQFVYKTRP | PREQPDTFPD | VMMNSYLGFS | ||||
LDSGKGIVSK | DEITFVSGAP | RANHSGAVVL | LKRDMKSAHL | LPEHIFDGEG | ||||
LASSFGYDVA | VVDLNKDGWQ | DIVIGAPQYF | DRDGEVGGAV | YVYMNQQGRW | ||||
NNVKPIRLNG | TKDSMFGIAV | KNIGDINQDG | YPDIAVGAPY | DDLGKVFIYH | ||||
GSANGINTKP | TQVLKGISPY | FGYSIAGNMD | LDRNSYPDVA | VGSLSDSVTI | ||||
FRSRPVINIQ | KTITVTPNRI | DLRQKTACGA | PSGICLQVKS | CFEYTANPAG | ||||
YNPSISIVGT | LEAEKERRKS | GLSSRVQFRN | QGSEPKYTQE | LTLKRQKQKV | ||||
CMEETLWLQD | NIRDKLRPIP | ITASVEIQEP | SSRRRVNSLP | EVLPILNSDE | ||||
PKTAHIDVHF | LKEGCGDDNV | CNSNLKLEYK | FCTREGNQDK | FSYLPIQKGV | ||||
PELVLKDQKD | IALEITVTNS | PSNPRNPTKD | GDDAHEAKLI | ATFPDTLTYS | ||||
AYRELRAFPE | KQLSCVANQN | GSQADCELGN | PFKRNSNVTF | YLVLSTTEVT | ||||
FDTPDLDINL | KLETTSNQDN | LAPITAKAKV | VIELLLSVSG | VAKPSQVYFG | ||||
GTVVGEQAMK | SEDEVGSLIE | YEFRVINLGK | PLTNLGTATL | NIQWPKEISN | ||||
GKWLLYLVKV | ESKGLEKVTC | EPQKEINSLN | LTESHNSRKK | REITEKQIDD | ||||
NRKFSLFAER | KYQTLNCSVN | VNCVNIRCPL | RGLDSKASLI | LRSRLWNSTF | ||||
LEEYSKLNYL | DILMRAFIDV | TAAAENIRLP | NAGTQVRVTV | FPSKTVAQYS | ||||
GVPWWIILVA | ILAGILMLAL | LVFILWKCGF | FKRSRYDDSV | PRYHAVRIRK | ||||
EEREIKDEKY | IDNLEKKQWI | TKWNENESYS |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hogervorst F., Kuikman I., Geurts van Kessel A., Sonnenberg A. (1991). Molecular cloning of the human alpha 6 integrin subunit. Alternative splicing of alpha 6 mRNA and chromosomal localization of the alpha 6 and beta 4 genes. Eur. J. Biochem. 199: 425—433. PMID 2070796 DOI:10.1111/j.1432-1033.1991.tb16140.x
- Tamura R.N., Cooper H.M., Collo G., Quaranta V. (1991). Cell type-specific integrin variants with alternative alpha chain cytoplasmic domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 10183—10187. PMID 1946438 DOI:10.1073/pnas.88.22.10183
- Catimel B., Parmentier S., Leung L.L., McGregor J.L. (1991). Separation of important new platelet glycoproteins (GPIa, GPIc, GPIc*, GPIIa and GMP-140) by F.P.L.C. Characterization by monoclonal antibodies and gas-phase sequencing. Biochem. J. 279: 419—425. PMID 1953640 DOI:10.1042/bj2790419
- Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200
- Pawar S.C., Demetriou M.C., Nagle R.B., Bowden G.T., Cress A.E. (2007). Integrin alpha6 cleavage: a novel modification to modulate cell migration. Exp. Cell Res. 313: 1080—1089. PMID 17303120 DOI:10.1016/j.yexcr.2007.01.006
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ITGA6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6142 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P23229 (англ.) . Архів оригіналу за 12 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
- Хромосома 2
|
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |