NGFR |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/3f/Protein_NGFR_PDB_1sg1.png/250px-Protein_NGFR_PDB_1sg1.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3EWV, 2N80, 2N97, 2N83 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | NGFR, CD271, Gp80-LTNFRSF16, p75(NTR), p75NTR, nerve growth factor receptor |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 162010 MGI: 97323 HomoloGene: 1877 GeneCards: NGFR |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • signal transducer activity • transmembrane signaling receptor activity • tumor necrosis factor-activated receptor activity • ubiquitin protein ligase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • coreceptor activity • neurotrophin binding • nerve growth factor binding • amyloid-beta binding • death receptor activity • signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • нуклеоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • integral component of plasma membrane • neuron projection • мембрана • cell surface • ендосома • клітинне ядро • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • ритмічний процес • regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • negative regulation of apoptotic process • neurotrophin TRK receptor signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • axon guidance • multicellular organism development • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of axonogenesis • нейробіологія розвитку • glucose homeostasis • positive regulation of axonogenesis • circadian regulation of gene expression • membrane protein intracellular domain proteolysis • диференціація клітин • inflammatory response • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • intracellular protein transport • positive regulation of apoptotic process • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • response to lipopolysaccharide • apoptotic signaling pathway • negative regulation of neuron projection development • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • positive regulation of protein localization to nucleus • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • negative regulation of blood vessel endothelial cell proliferation involved in sprouting angiogenesis • Rho protein signal transduction • cellular glucose homeostasis • neuron apoptotic process • cellular response to amyloid-beta |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c1/PBB_GE_NGFR_205858_at_fs.png/250px-PBB_GE_NGFR_205858_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 49.5 – 49.52 Mb | Хр. 11: 95.46 – 95.48 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
NGFR (англ. Nerve growth factor receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 427 амінокислот, а молекулярна маса — 45 183[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGAGATGRAM | | DGPRLLLLLL | | LGVSLGGAKE | | ACPTGLYTHS | | GECCKACNLG |
EGVAQPCGAN | | QTVCEPCLDS | | VTFSDVVSAT | | EPCKPCTECV | | GLQSMSAPCV |
EADDAVCRCA | | YGYYQDETTG | | RCEACRVCEA | | GSGLVFSCQD | | KQNTVCEECP |
DGTYSDEANH | | VDPCLPCTVC | | EDTERQLREC | | TRWADAECEE | | IPGRWITRST |
PPEGSDSTAP | | STQEPEAPPE | | QDLIASTVAG | | VVTTVMGSSQ | | PVVTRGTTDN |
LIPVYCSILA | | AVVVGLVAYI | | AFKRWNSCKQ | | NKQGANSRPV | | NQTPPPEGEK |
LHSDSGISVD | | SQSLHDQQPH | | TQTASGQALK | | GDGGLYSSLP | | PAKREEVEKL |
LNGSAGDTWR | | HLAGELGYQP | | EHIDSFTHEA | | CPVRALLASW | | ATQDSATLDA |
LLAALRRIQR | | ADLVESLCSE | | STATSPV |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, біологічні ритми, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Sehgal A., Patil N., Chao M. (1988). A constitutive promoter directs expression of the nerve growth factor receptor gene. Mol. Cell. Biol. 8: 3160—3167. PMID 2850481 DOI:10.1128/MCB.8.8.3160
- Khursigara G., Orlinick J.R., Chao M.V. (1999). Association of the p75 neurotrophin receptor with TRAF6. J. Biol. Chem. 274: 2597—2600. PMID 9915784 DOI:10.1074/jbc.274.5.2597
- Bai D., Chen H., Huang B.-R. (2003). RanBPM is a novel binding protein for p75NTR. Biochem. Biophys. Res. Commun. 309: 552—557. PMID 12963025 DOI:10.1016/j.bbrc.2003.08.033
- Chapman B.S., Eckart M.R., Kaufman S.E., Lapointe G.R. (1996). O-linked oligosaccharide on the 75-kDa neurotrophin receptor. J. Neurochem. 66: 1707—1716. PMID 8627329
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7809 (англ.) . Архів оригіналу за 29 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P08138 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|