IFNGR1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/83/Protein_IFNGR1_PDB_1fg9.png/250px-Protein_IFNGR1_PDB_1fg9.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1FG9, 1FYH, 1JRH | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | IFNGR1, CD119, IFNGR, IMD27A, IMD27B, interferon gamma receptor 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 107470 MGI: 107655 HomoloGene: 359 GeneCards: IFNGR1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • interferon-gamma receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0019974 cytokine binding • GO:0016518 cytokine receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • response to virus • regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • interferon-gamma-mediated signaling pathway • cytokine-mediated signaling pathway • microglial cell activation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • astrocyte activation • negative regulation of amyloid-beta clearance • positive regulation of amyloid-beta formation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a5/PBB_GE_IFNGR1_202727_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_IFNGR1_202727_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/82/PBB_GE_IFNGR1_211676_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_IFNGR1_211676_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_000416 NM_001363526 NM_001363527 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_000407 NP_001350455 NP_001350456 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 137.2 – 137.22 Mb | Хр. 10: 19.47 – 19.49 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
IFNGR1 (англ. Interferon gamma receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 489 амінокислот, а молекулярна маса — 54 405[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MALLFLLPLV | | MQGVSRAEMG | | TADLGPSSVP | | TPTNVTIESY | | NMNPIVYWEY |
QIMPQVPVFT | | VEVKNYGVKN | | SEWIDACINI | | SHHYCNISDH | | VGDPSNSLWV |
RVKARVGQKE | | SAYAKSEEFA | | VCRDGKIGPP | | KLDIRKEEKQ | | IMIDIFHPSV |
FVNGDEQEVD | | YDPETTCYIR | | VYNVYVRMNG | | SEIQYKILTQ | | KEDDCDEIQC |
QLAIPVSSLN | | SQYCVSAEGV | | LHVWGVTTEK | | SKEVCITIFN | | SSIKGSLWIP |
VVAALLLFLV | | LSLVFICFYI | | KKINPLKEKS | | IILPKSLISV | | VRSATLETKP |
ESKYVSLITS | | YQPFSLEKEV | | VCEEPLSPAT | | VPGMHTEDNP | | GKVEHTEELS |
SITEVVTTEE | | NIPDVVPGSH | | LTPIERESSS | | PLSSNQSEPG | | SIALNSYHSR |
NCSESDHSRN | | GFDTDSSCLE | | SHSSLSDSEF | | PPNNKGEIKT | | EGQELITVIK |
APTSFGYDKP | | HVLVDLLVDD | | SGKESLIGYR | | PTEDSKEFS |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Aguet M., Dembic Z., Merlin G. (1988). Molecular cloning and expression of the human interferon-gamma receptor. Cell. 55: 273—280. PMID 2971451 DOI:10.1016/0092-8674(88)90050-5
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Stueber D., Friedlein A., Fountoulakis M., Lahm H.-W., Garotta G. (1993). Alignment of disulfide bonds of the extracellular domain of the interferon gamma receptor and investigation of their role in biological activity. Biochemistry. 32: 2423—2430. PMID 8443182 DOI:10.1021/bi00060a038
- Thye T., Burchard G.D., Nilius M., Mueller-Myhsok B., Horstmann R.D. (2003). Genomewide linkage analysis identifies polymorphism in the human interferon-gamma receptor affecting Helicobacter pylori infection. Am. J. Hum. Genet. 72: 448—453. PMID 12516030 DOI:10.1086/367714
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5439 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P15260 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|