TLR9 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | TLR9, CD289, toll like receptor 9 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605474 MGI: 1932389 HomoloGene: 68126 GeneCards: TLR9 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
гідроксихлорохін, agatolimod sodium[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • siRNA binding • interleukin-1 receptor binding • transmembrane signaling receptor activity • 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity • protein homodimerization activity • unmethylated CpG binding • GO:0008329 pattern recognition receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • ендосома • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • early phagosome • Golgi membrane • клітинна мембрана • extracellular region • basolateral plasma membrane • apical plasma membrane • ендоплазматичний ретикулум • phagocytic vesicle • endolysosome membrane • лізосома • endosome membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • міжклітинний простір • endolysosome |
---|
Біологічний процес | • positive regulation of interleukin-18 production • positive regulation of toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of inflammatory response • positive regulation of interleukin-12 production • аксоноґенеза • positive regulation of interleukin-10 production • процес імунної системи • positive regulation of JUN kinase activity • negative regulation of interleukin-6 production • I-kappaB phosphorylation • positive regulation of JNK cascade • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • negative regulation of interleukin-8 production • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of ATPase-coupled calcium transmembrane transporter activity • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway • defense response to bacterium • maintenance of gastrointestinal epithelium • positive regulation of granulocyte macrophage colony-stimulating factor production • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of interleukin-8 production • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of tumor necrosis factor production • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of chemokine production • tumor necrosis factor production • toll-like receptor 9 signaling pathway • вроджений імунітет • inflammatory response • response to molecule of bacterial origin • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of interferon-beta production • toll-like receptor signaling pathway • phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process • positive regulation of immunoglobulin production • positive regulation of B cell proliferation • regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway • positive regulation of MAPK cascade • regulation of B cell differentiation • positive regulation of B cell activation • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • defense response to virus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 52.22 – 52.23 Mb | Хр. 9: 106.1 – 106.1 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TLR9 (англ. Toll like receptor 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 032 амінокислот, а молекулярна маса — 115 860[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGFCRSALHP | | LSLLVQAIML | | AMTLALGTLP | | AFLPCELQPH | | GLVNCNWLFL |
KSVPHFSMAA | | PRGNVTSLSL | | SSNRIHHLHD | | SDFAHLPSLR | | HLNLKWNCPP |
VGLSPMHFPC | | HMTIEPSTFL | | AVPTLEELNL | | SYNNIMTVPA | | LPKSLISLSL |
SHTNILMLDS | | ASLAGLHALR | | FLFMDGNCYY | | KNPCRQALEV | | APGALLGLGN |
LTHLSLKYNN | | LTVVPRNLPS | | SLEYLLLSYN | | RIVKLAPEDL | | ANLTALRVLD |
VGGNCRRCDH | | APNPCMECPR | | HFPQLHPDTF | | SHLSRLEGLV | | LKDSSLSWLN |
ASWFRGLGNL | | RVLDLSENFL | | YKCITKTKAF | | QGLTQLRKLN | | LSFNYQKRVS |
FAHLSLAPSF | | GSLVALKELD | | MHGIFFRSLD | | ETTLRPLARL | | PMLQTLRLQM |
NFINQAQLGI | | FRAFPGLRYV | | DLSDNRISGA | | SELTATMGEA | | DGGEKVWLQP |
GDLAPAPVDT | | PSSEDFRPNC | | STLNFTLDLS | | RNNLVTVQPE | | MFAQLSHLQC |
LRLSHNCISQ | | AVNGSQFLPL | | TGLQVLDLSH | | NKLDLYHEHS | | FTELPRLEAL |
DLSYNSQPFG | | MQGVGHNFSF | | VAHLRTLRHL | | SLAHNNIHSQ | | VSQQLCSTSL |
RALDFSGNAL | | GHMWAEGDLY | | LHFFQGLSGL | | IWLDLSQNRL | | HTLLPQTLRN |
LPKSLQVLRL | | RDNYLAFFKW | | WSLHFLPKLE | | VLDLAGNQLK | | ALTNGSLPAG |
TRLRRLDVSC | | NSISFVAPGF | | FSKAKELREL | | NLSANALKTV | | DHSWFGPLAS |
ALQILDVSAN | | PLHCACGAAF | | MDFLLEVQAA | | VPGLPSRVKC | | GSPGQLQGLS |
IFAQDLRLCL | | DEALSWDCFA | | LSLLAVALGL | | GVPMLHHLCG | | WDLWYCFHLC |
LAWLPWRGRQ | | SGRDEDALPY | | DAFVVFDKTQ | | SAVADWVYNE | | LRGQLEECRG |
RWALRLCLEE | | RDWLPGKTLF | | ENLWASVYGS | | RKTLFVLAHT | | DRVSGLLRAS |
FLLAQQRLLE | | DRKDVVVLVI | | LSPDGRRSRY | | VRLRQRLCRQ | | SVLLWPHQPS |
GQRSFWAQLG | | MALTRDNHHF | | YNRNFCQGPT | | AE |
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.
Література
- Georgel P., Macquin C., Bahram S. (2009). The heterogeneous allelic repertoire of human Toll-Like receptor (TLR) genes. PLoS ONE. 4: E7803—E7803. PMID 19924287 DOI:10.1371/journal.pone.0007803
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Doyle S.L., Jefferies C.A., Feighery C., O'Neill L.A. (2007). Signaling by Toll-like receptors 8 and 9 requires Bruton's tyrosine kinase. J. Biol. Chem. 282: 36953—36960. PMID 17932028 DOI:10.1074/jbc.M707682200
- Du X., Poltorak A., Wei Y., Beutler B. (2000). Three novel mammalian Toll-like receptors: gene structure, expression, and evolution. Eur. Cytokine Netw. 11: 362—371. PMID 11022119
- Chuang T.-H., Ulevitch R.J. (2000). Cloning and characterization of a sub-family of human Toll-like receptors: hTLR7, hTLR8 and hTLR9. Eur. Cytokine Netw. 11: 372—378. PMID 11022120
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Toll like receptor 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15633 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NR96 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|