SLAMF1 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/99/PDB_1d4t_EBI.jpg/250px-PDB_1d4t_EBI.jpg) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1M27, 1KA7, 1I3Z, 1D4T, 1D4W, 1KA6 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SLAMF1, CD150, CDw150, SLAM, signaling lymphocytic activation molecule family member 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603492 MGI: 1351314 HomoloGene: 48162 GeneCards: SLAMF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0003823, GO:0051635 antigen binding • virus receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane signaling receptor activity • identical protein binding • signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • extracellular region • cell surface • phagocytic vesicle • екзосома • external side of plasma membrane |
---|
Біологічний процес | • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • natural killer cell proliferation • T-helper 1 cell cytokine production • negative regulation of interleukin-6 production • positive regulation of JNK cascade • адгезія клітин • negative regulation of CD40 signaling pathway • negative regulation of T cell cytokine production • myeloid dendritic cell activation involved in immune response • regulation of vesicle fusion • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • Фагоцитоз • lymphocyte activation • viral entry into host cell • negative regulation of tumor necrosis factor production • вроджений імунітет • GO:0048552 regulation of catalytic activity • GO:0022415 viral process • positive regulation of activated T cell proliferation • negative regulation of interleukin-12 production • natural killer cell differentiation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • leukocyte chemotaxis involved in inflammatory response • positive regulation of macrophage chemotaxis • positive regulation of dendritic cell chemotaxis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/7b/PBB_GE_SLAMF1_206181_at_fs.png/250px-PBB_GE_SLAMF1_206181_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 160.61 – 160.65 Mb | Хр. 1: 171.59 – 171.63 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SLAMF1 (англ. Signaling lymphocytic activation molecule family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 37 231[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDPKGLLSLT | | FVLFLSLAFG | | ASYGTGGRMM | | NCPKILRQLG | | SKVLLPLTYE |
RINKSMNKSI | | HIVVTMAKSL | | ENSVENKIVS | | LDPSEAGPPR | | YLGDRYKFYL |
ENLTLGIRES | | RKEDEGWYLM | | TLEKNVSVQR | | FCLQLRLYEQ | | VSTPEIKVLN |
KTQENGTCTL | | ILGCTVEKGD | | HVAYSWSEKA | | GTHPLNPANS | | SHLLSLTLGP |
QHADNIYICT | | VSNPISNNSQ | | TFSPWPGCRT | | DPSETKPWAV | | YAGLLGGVIM |
ILIMVVILQL | | RRRGKTNHYQ | | TTVEKKSLTI | | YAQVQKPGPL | | QKKLDSFPAQ |
DPCTTIYVAA | | TEPVPESVQE | | TNSITVYASV | | TLPES |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Ferrand V., Li C., Romeo G., Yin L. (2003). Absence of SLAM mutations in EBV-associated lymphoproliferative disease patients. J. Med. Virol. 70: 131—136. PMID 12629654 DOI:10.1002/jmv.10373
- Tatsuo H., Ono N., Tanaka K., Yanagi Y. (2000). SLAM (CDw150) is a cellular receptor for measles virus. Nature. 406: 893—897. PMID 10972291 DOI:10.1038/35022579
- Li C., Iosef C., Jia C.Y., Han V.K., Li S.S. (2003). Dual functional roles for the X-linked lymphoproliferative syndrome gene product SAP/SH2D1A in signaling through the signaling lymphocyte activation molecule (SLAM) family of immune receptors. J. Biol. Chem. 278: 3852—3859. PMID 12458214 DOI:10.1074/jbc.M206649200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10903 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q13291 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2013. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Білки: кластери диференціації
1-50 | |
---|
51-100 | |
---|
101-150 | |
---|
151-200 | |
---|
201-250 | |
---|
251-300 | |
---|
301-350 | |
---|