ARID1B
ARID1B | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ARID1B, 6A3-5, BAF250B, BRIGHT, DAN15, ELD/OSA1, MRD12, OSA2, P250R, CSS1, AT-rich interaction domain 1B, SMARCF2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 614556 MGI: 1926129 HomoloGene: 32344 GeneCards: ARID1B | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 156.78 – 157.21 Mb | Хр. 17: 5.04 – 5.4 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
ARID1B (англ. AT-rich interaction domain 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 236 амінокислот, а молекулярна маса — 236 123[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAHNAGAAAA | AGTHSAKSGG | SEAALKEGGS | AAALSSSSSS | SAAAAAASSS | ||||
SSSGPGSAME | TGLLPNHKLK | TVGEAPAAPP | HQQHHHHHHA | HHHHHHAHHL | ||||
HHHHALQQQL | NQFQQQQQQQ | QQQQQQQQQQ | QHPISNNNSL | GGAGGGAPQP | ||||
GPDMEQPQHG | GAKDSAAGGQ | ADPPGPPLLS | KPGDEDDAPP | KMGEPAGGRY | ||||
EHPGLGALGT | QQPPVAVPGG | GGGPAAVPEF | NNYYGSAAPA | SGGPGGRAGP | ||||
CFDQHGGQQS | PGMGMMHSAS | AAAAGAPGSM | DPLQNSHEGY | PNSQCNHYPG | ||||
YSRPGAGGGG | GGGGGGGGGS | GGGGGGGGAG | AGGAGAGAVA | AAAAAAAAAA | ||||
GGGGGGGYGG | SSAGYGVLSS | PRQQGGGMMM | GPGGGGAASL | SKAAAGSAAG | ||||
GFQRFAGQNQ | HPSGATPTLN | QLLTSPSPMM | RSYGGSYPEY | SSPSAPPPPP | ||||
SQPQSQAAAA | GAAAGGQQAA | AGMGLGKDMG | AQYAAASPAW | AAAQQRSHPA | ||||
MSPGTPGPTM | GRSQGSPMDP | MVMKRPQLYG | MGSNPHSQPQ | QSSPYPGGSY | ||||
GPPGPQRYPI | GIQGRTPGAM | AGMQYPQQQM | PPQYGQQGVS | GYCQQGQQPY | ||||
YSQQPQPPHL | PPQAQYLPSQ | SQQRYQPQQD | MSQEGYGTRS | QPPLAPGKPN | ||||
HEDLNLIQQE | RPSSLPDLSG | SIDDLPTGTE | ATLSSAVSAS | GSTSSQGDQS | ||||
NPAQSPFSPH | ASPHLSSIPG | GPSPSPVGSP | VGSNQSRSGP | ISPASIPGSQ | ||||
MPPQPPGSQS | ESSSHPALSQ | SPMPQERGFM | AGTQRNPQMA | QYGPQQTGPS | ||||
MSPHPSPGGQ | MHAGISSFQQ | SNSSGTYGPQ | MSQYGPQGNY | SRPPAYSGVP | ||||
SASYSGPGPG | MGISANNQMH | GQGPSQPCGA | VPLGRMPSAG | MQNRPFPGNM | ||||
SSMTPSSPGM | SQQGGPGMGP | PMPTVNRKAQ | EAAAAVMQAA | ANSAQSRQGS | ||||
FPGMNQSGLM | ASSSPYSQPM | NNSSSLMNTQ | APPYSMAPAM | VNSSAASVGL | ||||
ADMMSPGESK | LPLPLKADGK | EEGTPQPESK | SKKSSSSTTT | GEKITKVYEL | ||||
GNEPERKLWV | DRYLTFMEER | GSPVSSLPAV | GKKPLDLFRL | YVCVKEIGGL | ||||
AQVNKNKKWR | ELATNLNVGT | SSSAASSLKK | QYIQYLFAFE | CKIERGEEPP | ||||
PEVFSTGDTK | KQPKLQPPSP | ANSGSLQGPQ | TPQSTGSNSM | AEVPGDLKPP | ||||
TPASTPHGQM | TPMQGGRSST | ISVHDPFSDV | SDSSFPKRNS | MTPNAPYQQG | ||||
MSMPDVMGRM | PYEPNKDPFG | GMRKVPGSSE | PFMTQGQMPN | SSMQDMYNQS | ||||
PSGAMSNLGM | GQRQQFPYGA | SYDRRHEPYG | QQYPGQGPPS | GQPPYGGHQP | ||||
GLYPQQPNYK | RHMDGMYGPP | AKRHEGDMYN | MQYSSQQQEM | YNQYGGSYSG | ||||
PDRRPIQGQY | PYPYSRERMQ | GPGQIQTHGI | PPQMMGGPLQ | SSSSEGPQQN | ||||
MWAARNDMPY | PYQNRQGPGG | PTQAPPYPGM | NRTDDMMVPD | QRINHESQWP | ||||
SHVSQRQPYM | SSSASMQPIT | RPPQPSYQTP | PSLPNHISRA | PSPASFQRSL | ||||
ENRMSPSKSP | FLPSMKMQKV | MPTVPTSQVT | GPPPQPPPIR | REITFPPGSV | ||||
EASQPVLKQR | RKITSKDIVT | PEAWRVMMSL | KSGLLAESTW | ALDTINILLY | ||||
DDSTVATFNL | SQLSGFLELL | VEYFRKCLID | IFGILMEYEV | GDPSQKALDH | ||||
NAARKDDSQS | LADDSGKEEE | DAECIDDDEE | DEEDEEEDSE | KTESDEKSSI | ||||
ALTAPDAAAD | PKEKPKQASK | FDKLPIKIVK | KNNLFVVDRS | DKLGRVQEFN | ||||
SGLLHWQLGG | GDTTEHIQTH | FESKMEIPPR | RRPPPPLSSA | GRKKEQEGKG | ||||
DSEEQQEKSI | IATIDDVLSA | RPGALPEDAN | PGPQTESSKF | PFGIQQAKSH | ||||
RNIKLLEDEP | RSRDETPLCT | IAHWQDSLAK | RCICVSNIVR | SLSFVPGNDA | ||||
EMSKHPGLVL | ILGKLILLHH | EHPERKRAPQ | TYEKEEDEDK | GVACSKDEWW | ||||
WDCLEVLRDN | TLVTLANISG | QLDLSAYTES | ICLPILDGLL | HWMVCPSAEA | ||||
QDPFPTVGPN | SVLSPQRLVL | ETLCKLSIQD | NNVDLILATP | PFSRQEKFYA | ||||
TLVRYVGDRK | NPVCREMSMA | LLSNLAQGDA | LAARAIAVQK | GSIGNLISFL | ||||
EDGVTMAQYQ | QSQHNLMHMQ | PPPLEPPSVD | MMCRAAKALL | AMARVDENRS | ||||
EFLLHEGRLL | DISISAVLNS | LVASVICDVL | FQIGQL |
Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Mangel L., Ternes T., Schmitz B., Doerfler W. (1998). New 5'-(CGG)-3' repeats in the human genome. J. Biol. Chem. 273: 30466—30471. PMID 9804814 DOI:10.1074/jbc.273.46.30466
- Martens J.A., Winston F. (2003). Recent advances in understanding chromatin remodeling by SWI/SNF complexes. Curr. Opin. Genet. Dev. 13: 136—142. PMID 12672490 DOI:10.1016/S0959-437X(03)00022-4
- Hurlstone A.F., Olave I.A., Barker N., van Noort M., Clevers H. (2002). Cloning and characterization of hELD/OSA1, a novel BRG1 interacting protein. Biochem. J. 364: 255—264. PMID 11988099
Примітки
Див. також
- Хромосома 6
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|