TAF4B |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1H3O, 2P6V | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TAF4B, SPGF13, TAF2C2, TAFII105, TATA-box binding protein associated factor 4b |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601689 MGI: 2152345 HomoloGene: 28266 GeneCards: TAF4B |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • NF-kappaB binding • protein heterodimerization activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • fibrillar center • transcription factor TFIID complex |
---|
Біологічний процес | • DNA-templated transcription, initiation • диференціація клітин • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • transcription, DNA-templated • Оогенез • regulation of signal transduction by p53 class mediator • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase II preinitiation complex assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/9d/PBB_GE_TAF4B_gnf1h09648_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_TAF4B_gnf1h09648_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001100449 NM_001369357 NM_001369358 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001093919 NP_001356286 NP_001356287 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 18: 26.23 – 26.39 Mb | Хр. 18: 14.92 – 15.03 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TAF4B (англ. TATA-box binding protein associated factor 4b) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 862 амінокислот, а молекулярна маса — 91 091[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPAGLTEPAG | | AAPPAAVSAS | | GTVTMAPAGA | | LPVRVESTPV | | ALGAVTKAPV |
SVCVEPTASQ | | PLRSPVGTLV | | TKVAPVSAPP | | KVSSGPRLPA | | PQIVAVKAPN |
TTTIQFPANL | | QLPPGTVLIK | | SNSGPLMLVS | | PQQTVTRAET | | TSNITSRPAV |
PANPQTVKIC | | TVPNSSSQLI | | KKVAVTPVKK | | LAQIGTTVVT | | TVPKPSSVQS |
VAVPTSVVTV | | TPGKPLNTVT | | TLKPSSLGAS | | STPSNEPNLK | | AENSAAVQIN |
LSPTMLENVK | | KCKNFLAMLI | | KLACSGSQSP | | EMGQNVKKLV | | EQLLDAKIEA |
EEFTRKLYVE | | LKSSPQPHLV | | PFLKKSVVAL | | RQLLPNSQSF | | IQQCVQQTSS |
DMVIATCTTT | | VTTSPVVTTT | | VSSSQSEKSI | | IVSGATAPRT | | VSVQTLNPLA |
GPVGAKAGVV | | TLHSVGPTAA | | TGGTTAGTGL | | LQTSKPLVTS | | VANTVTTVSL |
QPEKPVVSGT | | AVTLSLPAVT | | FGETSGAAIC | | LPSVKPVVSS | | AGTTSDKPVI |
GTPVQIKLAQ | | PGPVLSQPAG | | IPQAVQVKQL | | VVQQPSGGNE | | KQVTTISHSS |
TLTIQKCGQK | | TMPVNTIIPT | | SQFPPASILK | | QITLPGNKIL | | SLQASPTQKN |
RIKENVTSCF | | RDEDDINDVT | | SMAGVNLNEE | | NACILATNSE | | LVGTLIQSCK |
DEPFLFIGAL | | QKRILDIGKK | | HDITELNSDA | | VNLISQATQE | | RLRGLLEKLT |
AIAQHRMTTY | | KASENYILCS | | DTRSQLKFLE | | KLDQLEKQRK | | DLEEREMLLK |
AAKSRSNKED | | PEQLRLKQKA | | KELQQLELAQ | | IQHRDANLTA | | LAAIGPRKKR |
PLESGIEGLK | | DNLLASGTSS | | LTATKQLHRP | | RITRICLRDL | | IFCMEQEREM |
KYSRALYLAL | | LK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Wu Y., Lu Y., Hu Y., Li R. (2005). Cyclic AMP-dependent modification of gonad-selective TAF(II)105 in a human ovarian granulosa cell line. J. Cell. Biochem. 96: 751—759. PMID 16088961 DOI:10.1002/jcb.20577
- Dikstein R., Zhou S., Tjian R. (1996). Human TAFII 105 is a cell type-specific TFIID subunit related to hTAFII130. Cell. 87: 137—146. PMID 8858156 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81330-6
- Wolstein O., Silkov A., Revach M., Dikstein R. (2000). Specific interaction of TAFII105 with OCA-B is involved in activation of octamer-dependent transcription. J. Biol. Chem. 275: 16459—16465. PMID 10828057 DOI:10.1074/jbc.275.22.16459
- Yamit-Hezi A., Nir S., Wolstein O., Dikstein R. (2000). Interaction of TAFII105 with selected p65/RelA dimers is associated with activation of subset of NF-kappa B genes. J. Biol. Chem. 275: 18180—18187. PMID 10849440 DOI:10.1074/jbc.275.24.18180
- Rashevsky-Finkel A., Silkov A., Dikstein R. (2001). A composite nuclear export signal in the TBP-associated factor TAFII105. J. Biol. Chem. 276: 44963—44969. PMID 11567023 DOI:10.1074/jbc.M106112200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11538 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q92750 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|