ZEB1
ZEB1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ZEB1, zinc finger E-box binding homeobox 1, AREB6, BZP, DELTAEF1, FECD6, NIL2A, PPCD3, TCF8, ZFHEP, ZFHX1A | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 189909 MGI: 1344313 HomoloGene: 31779 GeneCards: ZEB1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Fuchs' endothelial dystrophy[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 10: 31.32 – 31.53 Mb | Хр. 18: 5.59 – 5.78 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
ZEB1 (англ. Zinc finger E-box binding homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 124 амінокислот, а молекулярна маса — 124 074[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MADGPRCKRR | KQANPRRNNV | TNYNTVVETN | SDSDDEDKLH | IVEEESVTDA | ||||
ADCEGVPEDD | LPTDQTVLPG | RSSEREGNAK | NCWEDDRKEG | QEILGPEAQA | ||||
DEAGCTVKDD | ECESDAENEQ | NHDPNVEEFL | QQQDTAVIFP | EAPEEDQRQG | ||||
TPEASGHDEN | GTPDAFSQLL | TCPYCDRGYK | RFTSLKEHIK | YRHEKNEDNF | ||||
SCSLCSYTFA | YRTQLERHMT | SHKSGRDQRH | VTQSGCNRKF | KCTECGKAFK | ||||
YKHHLKEHLR | IHSGEKPYEC | PNCKKRFSHS | GSYSSHISSK | KCISLIPVNG | ||||
RPRTGLKTSQ | CSSPSLSASP | GSPTRPQIRQ | KIENKPLQEQ | LSVNQIKTEP | ||||
VDYEFKPIVV | ASGINCSTPL | QNGVFTGGGP | LQATSSPQGM | VQAVVLPTVG | ||||
LVSPISINLS | DIQNVLKVAV | DGNVIRQVLE | NNQANLASKE | QETINASPIQ | ||||
QGGHSVISAI | SLPLVDQDGT | TKIIINYSLE | QPSQLQVVPQ | NLKKENPVAT | ||||
NSCKSEKLPE | DLTVKSEKDK | SFEGGVNDST | CLLCDDCPGD | INALPELKHY | ||||
DLKQPTQPPP | LPAAEAEKPE | SSVSSATGDG | NLSPSQPPLK | NLLSLLKAYY | ||||
ALNAQPSAEE | LSKIADSVNL | PLDVVKKWFE | KMQAGQISVQ | SSEPSSPEPG | ||||
KVNIPAKNND | QPQSANANEP | QDSTVNLQSP | LKMTNSPVLP | VGSTTNGSRS | ||||
STPSPSPLNL | SSSRNTQGYL | YTAEGAQEEP | QVEPLDLSLP | KQQGELLERS | ||||
TITSVYQNSV | YSVQEEPLNL | SCAKKEPQKD | SCVTDSEPVV | NVIPPSANPI | ||||
NIAIPTVTAQ | LPTIVAIADQ | NSVPCLRALA | ANKQTILIPQ | VAYTYSTTVS | ||||
PAVQEPPLKV | IQPNGNQDER | QDTSSEGVSN | VEDQNDSDST | PPKKKMRKTE | ||||
NGMYACDLCD | KIFQKSSSLL | RHKYEHTGKR | PHECGICKKA | FKHKHHLIEH | ||||
MRLHSGEKPY | QCDKCGKRFS | HSGSYSQHMN | HRYSYCKREA | EERDSTEQEE | ||||
AGPEILSNEH | VGARASPSQG | DSDERESLTR | EEDEDSEKEE | EEEDKEMEEL | ||||
QEEKECEKPQ | GDEEEEEEEE | EVEEEEVEEA | ENEGEEAKTE | GLMKDDRAES | ||||
QASSLGQKVG | ESSEQVSEEK | TNEA |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Long J., Zuo D., Park M. (2005). Pc2-mediated sumoylation of Smad-interacting protein 1 attenuates transcriptional repression of E-cadherin. J. Biol. Chem. 280: 35477—35489. PMID 16061479 DOI:10.1074/jbc.M504477200
- Papadopoulou V., Postigo A., Sanchez-Tillo E., Porter A.C., Wagner S.D. (2010). ZEB1 and CtBP form a repressive complex at a distal promoter element of the BCL6 locus. Biochem. J. 427: 541—550. PMID 20175752 DOI:10.1042/BJ20091578
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
- Chung D.W., Frausto R.F., Ann L.B., Jang M.S., Aldave A.J. (2014). Functional impact of ZEB1 mutations associated with posterior polymorphous and Fuchs' endothelial corneal dystrophies. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 55: 6159—6166. PMID 25190660 DOI:10.1167/iovs.14-15247
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ZEB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11642 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P37275 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 10
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|