KDM5D
KDM5D | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | KDM5D, HY, HYA, JARID1D, SMCY, lysine demethylase 5D | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 426000 MGI: 99780 HomoloGene: 55838 GeneCards: KDM5D | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. Y: 19.7 – 19.74 Mb | Хр. Y: 0.9 – 0.96 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
KDM5D (англ. Lysine demethylase 5D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 539 амінокислот, а молекулярна маса — 174 073[4].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEPGCDEFLP | PPECPVFEPS | WAEFQDPLGY | IAKIRPIAEK | SGICKIRPPA | ||||
DWQPPFAVEV | DNFRFTPRVQ | RLNELEAQTR | VKLNYLDQIA | KFWEIQGSSL | ||||
KIPNVERKIL | DLYSLSKIVI | EEGGYEAICK | DRRWARVAQR | LHYPPGKNIG | ||||
SLLRSHYERI | IYPYEMFQSG | ANHVQCNTHP | FDNEVKDKEY | KPHSIPLRQS | ||||
VQPSKFSSYS | RRAKRLQPDP | EPTEEDIEKH | PELKKLQIYG | PGPKMMGLGL | ||||
MAKDKDKTVH | KKVTCPPTVT | VKDEQSGGGN | VSSTLLKQHL | SLEPCTKTTM | ||||
QLRKNHSSAQ | FIDSYICQVC | SRGDEDDKLL | FCDGCDDNYH | IFCLLPPLPE | ||||
IPRGIWRCPK | CILAECKQPP | EAFGFEQATQ | EYSLQSFGEM | ADSFKSDYFN | ||||
MPVHMVPTEL | VEKEFWRLVS | SIEEDVTVEY | GADIHSKEFG | SGFPVSNSKQ | ||||
NLSPEEKEYA | TSGWNLNVMP | VLDQSVLCHI | NADISGMKVP | WLYVGMVFSA | ||||
FCWHIEDHWS | YSINYLHWGE | PKTWYGVPSL | AAEHLEEVMK | MLTPELFDSQ | ||||
PDLLHQLVTL | MNPNTLMSHG | VPVVRTNQCA | GEFVITFPRA | YHSGFNQGYN | ||||
FAEAVNFCTA | DWLPAGRQCI | EHYRRLRRYC | VFSHEELICK | MAAFPETLDL | ||||
NLAVAVHKEM | FIMVQEERRL | RKALLEKGVT | EAEREAFELL | PDDERQCIKC | ||||
KTTCFLSALA | CYDCPDGLVC | LSHINDLCKC | SSSRQYLRYR | YTLDELPTML | ||||
HKLKIRAESF | DTWANKVRVA | LEVEDGRKRS | FEELRALESE | ARERRFPNSE | ||||
LLQRLKNCLS | EVEACIAQVL | GLVSGQVARM | DTPQLTLTEL | RVLLEQMGSL | ||||
PCAMHQIGDV | KDVLEQVEAY | QAEAREALAT | LPSSPGLLRS | LLERGQQLGV | ||||
EVPEAHQLQQ | QVEQAQWLDE | VKQALAPSAH | RGSLVIMQGL | LVMGAKIASS | ||||
PSVDKARAEL | QELLTIAERW | EEKAHFCLEA | RQKHPPATLE | AIIRETENIP | ||||
VHLPNIQALK | EALTKAQAWI | ADVDEIQNGD | HYPCLDDLEG | LVAVGRDLPV | ||||
GLEELRQLEL | QVLTAHSWRE | KASKTFLKKN | SCYTLLEVLC | PCADAGSDST | ||||
KRSRWMEKAL | GLYQCDTELL | GLSAQDLRDP | GSVIVAFKEG | EQKEKEGILQ | ||||
LRRTNSAKPS | PLAPSLMASS | PTSICVCGQV | PAGVGVLQCD | LCQDWFHGQC | ||||
VSVPHLLTSP | KPSLTSSPLL | AWWEWDTKFL | CPLCMRSRRP | RLETILALLV | ||||
ALQRLPVRLP | EGEALQCLTE | RAIGWQDRAR | KALASEDVTA | LLRQLAELRQ | ||||
QLQAKPRPEE | ASVYTSATAC | DPIREGSGNN | ISKVQGLLEN | GDSVTSPENM | ||||
APGKGSDLEL | LSSLLPQLTG | PVLELPEAIR | APLEELMMEG | DLLEVTLDEN | ||||
HSIWQLLQAG | QPPDLDRIRT | LLELEKFEHQ | GSRTRSRALE | RRRRRQKVDQ | ||||
GRNVENLVQQ | ELQSKRARSS | GIMSQVGREE | EHYQEKADRE | NMFLTPSTDH | ||||
SPFLKGNQNS | LQHKDSGSSA | ACPSLMPLLQ | LSYSDEQQL |
Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Agulnik A.I., Bishop C.E., Lerner J.L., Agulnik S.I., Solovyev V.V. (1997). Analysis of mutation rates in the SMCY/SMCX genes shows that mammalian evolution is male driven. Mamm. Genome. 8: 134—138. PMID 9060413 DOI:10.1007/s003359900372
- Lee M.G., Norman J., Shilatifard A., Shiekhattar R. (2007). Physical and functional association of a trimethyl H3K4 demethylase and Ring6a/MBLR, a polycomb-like protein. Cell. 128: 877—887. PMID 17320162 DOI:10.1016/j.cell.2007.02.004
- Akimoto C., Kitagawa H., Matsumoto T., Kato S. (2008). Spermatogenesis-specific association of SMCY and MSH5. Genes Cells. 13: 623—633. PMID 18459961 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01193.x
Примітки
Див. також
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|