PHF6 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c4/4nn2.png/250px-4nn2.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 4NN2, 4R7A | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PHF6, BFLS, BORJ, CENP-31, PHD finger protein 6 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 300414 MGI: 1918248 HomoloGene: 12375 GeneCards: PHF6 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Borjeson-Forssman-Lehmann syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • tubulin binding • enzyme binding • scaffold protein binding • DNA binding • ribonucleoprotein complex binding • GO:0031493 histone binding • phosphoprotein binding • histone deacetylase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • ядерце • центромера • клітинне ядро • кінетохор • нуклеоплазма • хромосома |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • blastocyst hatching |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/00/PBB_GE_PHF6_gnf1h00721_at_fs.png/250px-PBB_GE_PHF6_gnf1h00721_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_032458 NM_001015877 NM_032335 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001015877 NP_115711 NP_115834 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. X: 134.37 – 134.43 Mb | Хр. X: 52 – 52.05 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PHF6 (англ. PHD finger protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот, а молекулярна маса — 41 290[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSSSVEQKKG | | PTRQRKCGFC | | KSNRDKECGQ | | LLISENQKVA | | AHHKCMLFSS |
ALVSSHSDNE | | SLGGFSIEDV | | QKEIKRGTKL | | MCSLCHCPGA | | TIGCDVKTCH |
RTYHYHCALH | | DKAQIREKPS | | QGIYMVYCRK | | HKKTAHNSEA | | DLEESFNEHE |
LEPSSPKSKK | | KSRKGRPRKT | | NFKGLSEDTR | | STSSHGTDEM | | ESSSYRDRSP |
HRSSPSDTRP | | KCGFCHVGEE | | ENEARGKLHI | | FNAKKAAAHY | | KCMLFSSGTV |
QLTTTSRAEF | | GDFDIKTVLQ | | EIKRGKRMKC | | TLCSQPGATI | | GCEIKACVKT |
YHYHCGVQDK | | AKYIENMSRG | | IYKLYCKNHS | | GNDERDEEDE | | ERESKSRGKV |
EIDQQQLTQQ | | QLNGN |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах, кінетохорі.
Література
- Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PHF6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18145 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IWS0 (англ.) . Архів оригіналу за 20 листопада 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|