ARID2
ARID2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ARID2, BAF200, p200, AT-rich interaction domain 2, CSS6, SMARCF3 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 609539 MGI: 1924294 HomoloGene: 14601 GeneCards: ARID2 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Coffin-Siris syndrome 6, liver carcinoma[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 45.73 – 45.91 Mb | Хр. 15: 96.19 – 96.3 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
ARID2 (англ. AT-rich interaction domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 835 амінокислот, а молекулярна маса — 197 391[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MANSTGKAPP | DERRKGLAFL | DELRQFHHSR | GSPFKKIPAV | GGKELDLHGL | ||||
YTRVTTLGGF | AKVSEKNQWG | EIVEEFNFPR | SCSNAAFALK | QYYLRYLEKY | ||||
EKVHHFGEDD | DEVPPGNPKP | QLPIGAIPSS | YNYQQHSVSD | YLRQSYGLSM | ||||
DFNSPNDYNK | LVLSLLSGLP | NEVDFAINVC | TLLSNESKHV | MQLEKDPKII | ||||
TLLLANAGVF | DDTLGSFSTV | FGEEWKEKTD | RDFVKFWKDI | VDDNEVRDLI | ||||
SDRNKSHEGT | SGEWIWESLF | HPPRKLGIND | IEGQRVLQIA | VILRNLSFEE | ||||
GNVKLLAANR | TCLRFLLLSA | HSHFISLRQL | GLDTLGNIAA | ELLLDPVDFK | ||||
TTHLMFHTVT | KCLMSRDRFL | KMRGMEILGN | LCKAEDNGVL | ICEYVDQDSY | ||||
REIICHLTLP | DVLLVISTLE | VLYMLTEMGD | VACTKIAKVE | KSIDMLVCLV | ||||
SMDIQMFGPD | ALAAVKLIEH | PSSSHQMLSE | IRPQAIEQVQ | TQTHVASAPA | ||||
SRAVVAQHVA | PPPGIVEIDS | EKFACQWLNA | HFEVNPDCSV | SRAEMYSEYL | ||||
STCSKLARGG | ILTSTGFYKC | LRTVFPNHTV | KRVEDSSSNG | QAHIHVVGVK | ||||
RRAIPLPIQM | YYQQQPVSTS | VVRVDSVPDV | SPAPSPAGIP | HGSQTIGNHF | ||||
QRTPVANQSS | NLTATQMSFP | VQGVHTVAQT | VSRIPQNPSP | HTHQQQNAPV | ||||
TVIQSKAPIP | CEVVKATVIQ | NSIPQTGVPV | SIAVGGGPPQ | SSVVQNHSTG | ||||
PQPVTVVNSQ | TLLHHPSVIP | QQSPLHTVVP | GQIPSGTPVT | VIQQAVPQSH | ||||
MFGRVQNIPA | CTSTVSQGQQ | LITTSPQPVQ | TSSQQTSAGS | QSQDTVIIAP | ||||
PQYVTTSASN | IVSATSVQNF | QVATGQMVTI | AGVPSPQASR | VGFQNIAPKP | ||||
LPSQQVSSTV | VQQPIQQPQQ | PTQQSVVIVS | QPAQQGQTYA | PAIHQIVLAN | ||||
PAALPAGQTV | QLTGQPNITP | SSSPSPVPAT | NNQVPTAMSS | SSTPQSQGPP | ||||
PTVSQMLSVK | RQQQQQHSPA | PPPQQVQVQV | QQPQQVQMQV | QPQQSNAGVG | ||||
QPASGESSLI | KQLLLPKRGP | STPGGKLILP | APQIPPPNNA | RAPSPQVVYQ | ||||
VASNQAAGFG | VQGQTPAQQL | LVGQQNVQLV | PSAMPPSGGV | QTVPISNLQI | ||||
LPGPLISNSP | ATIFQGTSGN | QVTITVVPNT | SFAPATVSQG | NATQLIAPAG | ||||
ITMSGTQTGV | GLPVQTLPAT | QASPAGQSSC | TTATPPFKGD | KIICQKEEEA | ||||
KEATGLHVHE | RKIEVMENPS | CRRGATNTSN | GDTKENEMHV | GSLLNGRKYS | ||||
DSSLPPSNSG | KIQSETNQCS | LISNGPSLEL | GENGASGKQN | SEQIDMQDIK | ||||
SDLRKPLVNG | ICDFDKGDGS | HLSKNIPNHK | TSNHVGNGEI | SPMEPQGTLD | ||||
ITQQDTAKGD | QLERISNGPV | LTLGGSSVSS | IQEASNAATQ | QFSGTDLLNG | ||||
PLASSLNSDV | PQQRPSVVVS | PHSTTSVIQG | HQIIAVPDSG | SKVSHSPALS | ||||
SDVRSTNGTA | ECKTVKRPAE | DTDRETVAGI | PNKVGVRIVT | ISDPNNAGCS | ||||
ATMVAVPAGA | DPSTVAKVAI | ESAVQQKQQH | PPTYVQNVVP | QNTPMPPSPA | ||||
VQVQGQPNSS | QPSPFSGSSQ | PGDPMRKPGQ | NFMCLWQSCK | KWFQTPSQVF | ||||
YHAATEHGGK | DVYPGQCLWE | GCEPFQRQRF | SFITHLQDKH | CSKDALLAGL | ||||
KQDEPGQAGS | QKSSTKQPTV | GGTSSTPRAQ | KAIVNHPSAA | LMALRRGSRN | ||||
LVFRDFTDEK | EGPITKHIRL | TAALILKNIG | KYSECGRRLL | KRHENNLSVL | ||||
AISNMEASST | LAKCLYELNF | TVQSKEQEKD | SEMLQ |
Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Zhang X., Azhar G., Zhong Y., Wei J.Y. (2006). Zipzap/p200 is a novel zinc finger protein contributing to cardiac gene regulation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 346: 794—801. PMID 16782067 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.05.211
- Patsialou A., Wilsker D., Moran E. (2005). DNA-binding properties of ARID family proteins. Nucleic Acids Res. 33: 66—80. PMID 15640446 DOI:10.1093/nar/gki145
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- Martens J.A., Winston F. (2003). Recent advances in understanding chromatin remodeling by SWI/SNF complexes. Curr. Opin. Genet. Dev. 13: 136—142. PMID 12672490 DOI:10.1016/S0959-437X(03)00022-4
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ARID2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18037 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q68CP9 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 12
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|