FHL3 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fa/Protein_FHL3_PDB_1wyh.png/250px-Protein_FHL3_PDB_1wyh.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1WYH, 2CUQ, 2EHE | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | FHL3, SLIM2, four and a half LIM domains 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602790 MGI: 1341092 HomoloGene: 37928 GeneCards: FHL3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • Z discdkac • клітинне ядро • stress fiber • focal adhesion |
---|
Біологічний процес | • muscle organ development • actin cytoskeleton organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/64/PBB_GE_FHL3_218818_at_fs.png/250px-PBB_GE_FHL3_218818_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001230807 NP_004459 NP_001230807.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 38 – 38.01 Mb | Хр. 4: 124.59 – 124.6 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
FHL3 (англ. Four and a half LIM domains 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 280 амінокислот, а молекулярна маса — 31 192[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSESFDCAKC | | NESLYGRKYI | | QTDSGPYCVP | | CYDNTFANTC | | AECQQLIGHD |
SRELFYEDRH | | FHEGCFRCCR | | CQRSLADEPF | | TCQDSELLCN | | DCYCSAFSSQ |
CSACGETVMP | | GSRKLEYGGQ | | TWHEHCFLCS | | GCEQPLGSRS | | FVPDKGAHYC |
VPCYENKFAP | | RCARCSKTLT | | QGGVTYRDQP | | WHRECLVCTG | | CQTPLAGQQF |
TSRDEDPYCV | | ACFGELFAPK | | CSSCKRPIVG | | LGGGKYVSFE | | DRHWHHNCFS |
CARCSTSLVG | | QGFVPDGDQV | | LCQGCSQAGP |
Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
- Morgan M.J., Madgwick A.J.A. (1999). The LIM proteins FHL1 and FHL3 are expressed differently in skeletal muscle. Biochem. Biophys. Res. Commun. 255: 245—250. PMID 10049693 DOI:10.1006/bbrc.1999.0179
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Morgan M.J., Madgwick A.J.A. (1996). Slim defines a novel family of LIM-proteins expressed in skeletal muscle. Biochem. Biophys. Res. Commun. 225: 632—638. PMID 8753811 DOI:10.1006/bbrc.1996.1222
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3704 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q13643 (англ.) . Архів оригіналу за 13 листопада 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |