GTF3C1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | GTF3C1, TFIIIC, TFIIIC220, TFIIICalpha, general transcription factor IIIC subunit 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603246 MGI: 107887 HomoloGene: 31040 GeneCards: GTF3C1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase III general transcription initiation factor activity • RNA polymerase III type 1 promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase III type 2 promoter sequence-specific DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • transcription factor TFIIIC complex • ядерце • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • Рибонуклеопротеїни |
---|
Біологічний процес | • tRNA transcription by RNA polymerase III • rRNA transcription • tRNA transcription • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III • regulation of transcription by RNA polymerase III • transcription initiation from RNA polymerase III promoter • 5S class rRNA transcription by RNA polymerase III |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/86/PBB_GE_GTF3C1_202320_at_fs.png/250px-PBB_GE_GTF3C1_202320_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fa/PBB_GE_GTF3C1_35671_at_fs.png/250px-PBB_GE_GTF3C1_35671_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 27.46 – 27.55 Mb | Хр. 7: 125.24 – 125.31 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GTF3C1 (англ. General transcription factor IIIC subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 109 амінокислот, а молекулярна маса — 238 875[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDALESLLDE | | VALEGLDGLC | | LPALWSRLET | | RVPPFPLPLE | | PCTQEFLWRA |
LATHPGISFY | | EEPRERPDLQ | | LQDRYEEIDL | | ETGILESRRD | | PVALEDVYPI |
HMILENKDGI | | QGSCRYFKER | | KNITNDIRTK | | SLQPRCTMVE | | AFDRWGKKLI |
IVASQAMRYR | | ALIGQEGDPD | | LKLPDFSYCI | | LERLGRSRWQ | | GELQRDLHTT |
AFKVDAGKLH | | YHRKILNKNG | | LITMQSHVIR | | LPTGAQQHSI | | LLLLNRFHVD |
RRSKYDILME | | KLSVMLSTRT | | NHIETLGKLR | | EELGLCERTF | | KRLYQYMLNA |
GLAKVVSLRL | | QEIHPECGPC | | KTKKGTDVMV | | RCLKLLKEFK | | RNDHDDDEDE |
EVISKTVPPV | | DIVFERDMLT | | QTYDLIERRG | | TKGISQAEIR | | VAMNVGKLEA |
RMLCRLLQRF | | KVVKGFMEDE | | GRQRTTKYIS | | CVFAEESDLS | | RQYQREKARS |
ELLTTVSLAS | | MQEESLLPEG | | EDTFLSESDS | | EEERSSSKRR | | GRGSQKDTRA |
SANLRPKTQP | | HHSTPTKGGW | | KVVNLHPLKK | | QPPSFPGAAE | | ERACQSLASR |
DSLLDTSSVS | | EPNVSFVSHC | | ADSNSGDIAV | | IEEVRMENPK | | ESSSSLKTGR |
HSSGQDKPHE | | TYRLLKRRNL | | IIEAVTNLRL | | IESLFTIQKM | | IMDQEKQEGV |
STKCCKKSIV | | RLVRNLSEEG | | LLRLYRTTVI | | QDGIKKKVDL | | VVHPSMDQND |
PLVRSAIEQV | | RFRISNSSTA | | NRVKTSQPPV | | PQGEAEEDSQ | | GKEGPSGSGD |
SQLSASSRSE | | SGRMKKSDNK | | MGITPLRNYH | | PIVVPGLGRS | | LGFLPKMPRL |
RVVHMFLWYL | | IYGHPASNTV | | EKPSFISERR | | TIKQESGRAG | | VRPSSSGSAW |
EACSEAPSKG | | SQDGVTWEAE | | VELATETVYV | | DDASWMRYIP | | PIPVHRDFGF |
GWALVSDILL | | CLPLSIFIQI | | VQVSYKVDNL | | EEFLNDPLKK | | HTLIRFLPRP |
IRQQLLYKRR | | YIFSVVENLQ | | RLCYMGLLQF | | GPTEKFQDKD | | QVFIFLKKNA |
VIVDTTICDP | | HYNLARSSRP | | FERRLYVLNS | | MQDVENYWFD | | LQCVCLNTPL |
GVVRCPRVRK | | NSSTDQGSDE | | EGSLQKEQES | | AMDKHNLERK | | CAMLEYTTGS |
REVVDEGLIP | | GDGLGAAGLD | | SSFYGHLKRN | | WIWTSYIINQ | | AKKENTAAEN |
GLTVRLQTFL | | SKRPMPLSAR | | GNSRLNIWGE | | ARVGSELCAG | | WEEQFEVDRE |
PSLDRNRRVR | | GGKSQKRKRL | | KKDPGKKIKR | | KKKGEFPGEK | | SKRLRYHDEA |
DQSALQRMTR | | LRVTWSMQED | | GLLVLCRIAS | | NVLNTKVKGP | | FVTWQVVRDI |
LHATFEESLD | | KTSHSVGRRA | | RYIVKNPQAY | | LNYKVCLAEV | | YQDKALVGDF |
MNRRGDYDDP | | KVCANEFKEF | | VEKLKEKFSS | | ALRNSNLEIP | | DTLQELFARY |
RVLAIGDEKD | | QTRKEDELNS | | VDDIHFLVLQ | | NLIQSTLALS | | DSQMKSYQSF |
QTFRLYREYK | | DHVLVKAFME | | CQKRSLVNRR | | RVNHTLGPKK | | NRALPFVPMS |
YQLSQTYYRI | | FTWRFPSTIC | | TESFQFLDRM | | RAAGKLDQPD | | RFSFKDQDNN |
EPTNDMVAFS | | LDGPGGNCVA | | VLTLFSLGLI | | SVDVRIPEQI | | IVVDSSMVEN |
EVIKSLGKDG | | SLEDDEDEED | | DLDEGVGGKR | | RSMEVKPAQA | | SHTNYLLMRG |
YYSPGIVSTR | | NLNPNDSIVV | | NSCQMKFQLR | | CTPVPARLRP | | AAAPLEELTM |
GTSCLPDTFT | | KLINPQENTC | | SLEEFVLQLE | | LSGYSPEDLT | | AALEILEAII |
ATGCFGIDKE | | ELRRRFSALE | | KAGGGRTRTF | | ADCIQALLEQ | | HQVLEVGGNT |
ARLVAMGSAW | | PWLLHSVRLK | | DREDADIQRE | | DPQARPLEGS | | SSEDSPPEGQ |
APPSHSPRGT | | KRRASWASEN | | GETDAEGTQM | | TPAKRPALQD | | SNLAPSLGPG |
AEDGAEAQAP | | SPPPALEDTA | | AAGAAQEDQE | | GVGEFSSPGQ | | EQLSGQAQPP |
EGSEDPRGFT | | ESFGAANISQ | | AARERDCESV | | CFIGRPWRVV | | DGHLNLPVCK |
GMMEAMLYHI | | MTRPGIPESS | | LLRHYQGVLQ | | PVAVLELLQG | | LESLGCIRKR |
WLRKPRPVSL | | FSTPVVEEVE | | VPSSLDESPM | | AFYEPTLDCT | | LRLGRVFPHE |
VNWNKWIHL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- L'Etoile N.D., Fahnestock M.L., Shen Y., Aebersold R., Berk A.J. (1994). Human transcription factor IIIC box B binding subunit. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 1652—1656. PMID 8127861 DOI:10.1073/pnas.91.5.1652
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lagna G., Kovelman R., Sukegawa J., Roeder R.G. (1994). Cloning and characterization of an evolutionarily divergent DNA-binding subunit of mammalian TFIIIC. Mol. Cell. Biol. 14: 3053—3064. PMID 8164661 DOI:10.1128/MCB.14.5.3053
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- de Planell-Saguer M., Schroeder D.G., Rodicio M.C., Cox G.A., Mourelatos Z. (2009). Biochemical and genetic evidence for a role of IGHMBP2 in the translational machinery. Hum. Mol. Genet. 18: 2115—2126. PMID 19299493 DOI:10.1093/hmg/ddp134
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4664 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q12789 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|