PRDM9
PRDM9 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | PRDM9, MEISETZ, MSBP3, PFM6, PRMD9, ZNF899, PR domain 9, PR/SET domain 9, KMT8B | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 609760 MGI: 2384854 HomoloGene: 104139 GeneCards: PRDM9 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 5: 23.44 – 23.53 Mb | Хр. 17: 15.54 – 15.56 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
PRDM9 (англ. PR/SET domain 9, PR domain zinc finger protein 9) – білок, який кодується геном PRDM9, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 894 амінокислот, а молекулярна маса — 103 376[4]. Фермент, який здатен додавати три метильні групи до 4-го лізину H3-гістону (H3K4-3me, див. табл "Порівняння еу- та гетерохроматину")[5]. Структурно Prdm9 має домен KRAB, та декілька тандемних цинкових пальців C2H2, що здатні зв'язуватися з ДНК[6]. Функції Prdm9 полягають у триметилюванні H3K4 під час мейотичної профази, що є потрібною стадією для проходження мейозу. Проте білок Prdm9 не здатен до ди- та моно-метилювання 4-го лізину H3-гістону[en].
Цей білок за функціями належить до трансфераз, активаторів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція транскрипції, мейоз. Білок має сайт для зв'язування з іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах.
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSPEKSQEES | PEEDTERTER | KPMVKDAFKD | ISIYFTKEEW | AEMGDWEKTR | ||||
YRNVKRNYNA | LITIGLRATR | PAFMCHRRQA | IKLQVDDTED | SDEEWTPRQQ | ||||
VKPPWMALRV | EQRKHQKGMP | KASFSNESSL | KELSRTANLL | NASGSEQAQK | ||||
PVSPSGEAST | SGQHSRLKLE | LRKKETERKM | YSLRERKGHA | YKEVSEPQDD | ||||
DYLYCEMCQN | FFIDSCAAHG | PPTFVKDSAV | DKGHPNRSAL | SLPPGLRIGP | ||||
SGIPQAGLGV | WNEASDLPLG | LHFGPYEGRI | TEDEEAANNG | YSWLITKGRN | ||||
CYEYVDGKDK | SWANWMRYVN | CARDDEEQNL | VAFQYHRQIF | YRTCRVIRPG | ||||
CELLVWYGDE | YGQELGIKWG | SKWKKELMAG | REPKPEIHPC | PSCCLAFSSQ | ||||
KFLSQHVERN | HSSQNFPGPS | ARKLLQPENP | CPGDQNQEQQ | YPDPHSRNDK | ||||
TKGQEIKERS | KLLNKRTWQR | EISRAFSSPP | KGQMGSCRVG | KRIMEEESRT | ||||
GQKVNPGNTG | KLFVGVGISR | IAKVKYGECG | QGFSVKSDVI | THQRTHTGEK | ||||
LYVCRECGRG | FSWKSHLLIH | QRIHTGEKPY | VCRECGRGFS | WQSVLLTHQR | ||||
THTGEKPYVC | RECGRGFSRQ | SVLLTHQRRH | TGEKPYVCRE | CGRGFSRQSV | ||||
LLTHQRRHTG | EKPYVCRECG | RGFSWQSVLL | THQRTHTGEK | PYVCRECGRG | ||||
FSWQSVLLTH | QRTHTGEKPY | VCRECGRGFS | NKSHLLRHQR | THTGEKPYVC | ||||
RECGRGFRDK | SHLLRHQRTH | TGEKPYVCRE | CGRGFRDKSN | LLSHQRTHTG | ||||
EKPYVCRECG | RGFSNKSHLL | RHQRTHTGEK | PYVCRECGRG | FRNKSHLLRH | ||||
QRTHTGEKPY | VCRECGRGFS | DRSSLCYHQR | THTGEKPYVC | REDE |
Див. також
- Хромосома 5
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13994 (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2018. Процитовано 12 лютого 2018.
- ↑ UniProt, Q9NQV7 (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2018. Процитовано 12 лютого 2018.
- ↑ Entrez Gene: PR domain containing 9.
- ↑ Thomas JH, Emerson RO, Shendure J (2009). Extraordinary molecular evolution in the PRDM9 fertility gene. PLoS ONE. 4 (12): e8505. doi:10.1371/journal.pone.0008505. PMC 2794550. PMID 20041164.
{{cite journal}}
: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
Література
- Jiang G.L., Huang S. (2000). The yin-yang of PR-domain family genes in tumorigenesis. Histol. Histopathol. 15: 109—117. PMID 10668202
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|