RXRA
RXRA | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | RXRA, NR2B1, Retinoid X receptor alpha, RXR-alpha, RXRalpha | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 180245 MGI: 98214 HomoloGene: 2220 GeneCards: RXRA | ||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
alitretinoin, bexarotene[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
![]() ![]() | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 9: 134.32 – 134.44 Mb | Хр. 2: 27.57 – 27.65 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
RXRA (англ. Retinoid X receptor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 462 амінокислот, а молекулярна маса — 50 811[5].
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDTKHFLPLD | FSTQVNSSLT | SPTGRGSMAA | PSLHPSLGPG | IGSPGQLHSP | ||||
ISTLSSPING | MGPPFSVISS | PMGPHSMSVP | TTPTLGFSTG | SPQLSSPMNP | ||||
VSSSEDIKPP | LGLNGVLKVP | AHPSGNMASF | TKHICAICGD | RSSGKHYGVY | ||||
SCEGCKGFFK | RTVRKDLTYT | CRDNKDCLID | KRQRNRCQYC | RYQKCLAMGM | ||||
KREAVQEERQ | RGKDRNENEV | ESTSSANEDM | PVERILEAEL | AVEPKTETYV | ||||
EANMGLNPSS | PNDPVTNICQ | AADKQLFTLV | EWAKRIPHFS | ELPLDDQVIL | ||||
LRAGWNELLI | ASFSHRSIAV | KDGILLATGL | HVHRNSAHSA | GVGAIFDRVL | ||||
TELVSKMRDM | QMDKTELGCL | RAIVLFNPDS | KGLSNPAEVE | ALREKVYASL | ||||
EAYCKHKYPE | QPGRFAKLLL | RLPALRSIGL | KCLEHLFFFK | LIGDTPIDTF | ||||
LMEMLEAPHQ | MT |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Mangelsdorf D.J., Ong E.S., Dyck J.A., Evans R.M. (1990). Nuclear receptor that identifies a novel retinoic acid response pathway. Nature. 345: 224—229. PMID 2159111 DOI:10.1038/345224a0
- Kobayashi T., Kodani Y., Nozawa A., Endo Y., Sawasaki T. (2008). DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system. FEBS Lett. 582: 2737—2744. PMID 18619963 DOI:10.1016/j.febslet.2008.07.003
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gorla-Bajszczak A., Juge-Aubry C., Pernin A., Burger A.G., Meier C.A. (1999). Conserved amino acids in the ligand-binding and tau(i) domains of the peroxisome proliferator-activated receptor alpha are necessary for heterodimerization with RXR. Mol. Cell. Endocrinol. 147: 37—47. PMID 10195690 DOI:10.1016/S0303-7207(98)00217-2
- Harish S., Ashok M.S., Khanam T., Rangarajan P.N. (2000). Serine 27, a human retinoid X receptor alpha residue, phosphorylated by protein kinase A is essential for cyclicAMP-mediated downregulation of RXRalpha function. Biochem. Biophys. Res. Commun. 279: 853—857. PMID 11162439 DOI:10.1006/bbrc.2000.4043
- Mathur M., Tucker P.W., Samuels H.H. (2001). PSF is a novel corepressor that mediates its effect through Sin3A and the DNA binding domain of nuclear hormone receptors. Mol. Cell. Biol. 21: 2298—2311. PMID 11259580 DOI:10.1128/MCB.21.7.2298-2311.2001
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Retinoid X receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10477 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P19793 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
- Хромосома 9
![]() | Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
|