ZNF318 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZNF318, TZF, ZFP318, HRIHFB2436, zinc finger protein 318 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 617512 MGI: 1889348 HomoloGene: 22808 GeneCards: ZNF318 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
Viroporin 3a[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • protein homodimerization activity |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0007126 мейоз • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/04/PBB_GE_ZNF318_203521_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ZNF318_203521_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ef/PBB_GE_ZNF318_203520_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_ZNF318_203520_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 43.31 – 43.37 Mb | Хр. 17: 46.69 – 46.73 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZNF318 (англ. Zinc finger protein 318) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 279 амінокислот, а молекулярна маса — 251 112[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MYRSSARSSV | | SSHRPKDDGG | | GGPRSGRSSG | | SSSGPARRSS | | PPPPPSGSSS |
RTPARRPRSP | | SGHRGRRASP | | SPPRGRRVSP | | SPPRARRGSP | | SPPRGRRLFP |
PGPAGFRGSS | | RGESRADYAR | | DGRGDHPGDS | | GSRRRSPGLC | | SDSLEKSLRI |
TVGNDHFCVS | | TPERRRLSDR | | LGSPVDNLED | | MDRDDLTDDS | | VFTRSSQCSR |
GLERYISQEE | | GPLSPFLGQL | | DEDYRTKETF | | LHRSDYSPHI | | SCHDELLRGT |
ERNREKLKGY | | SIRSEERSRE | | AKRPRYDDTV | | KINSMGGDHP | | SFTSGTRNYR |
QRRRSPSPRF | | LDPEFRELDL | | ARRKREEEEE | | RSRSLSQELV | | GVDGGGTGCS |
IPGLSGVLTA | | SEPGYSLHRP | | EEVSVMPKKS | | ILKKRIEVDI | | MEPSMQLESF |
SSSTSSSQDH | | PLYSGHPSLP | | LSGAIAAFAS | | EIENKGTMVE | | TALKEPQGNL |
YQWGPLPGIP | | KDNSPLREKF | | GSFLCHKDNL | | DLKAEGPERH | | TDFLLPHERA |
SQDGSGFSRI | | LSMLADSTST | | QEKRRRSFPD | | IEDEEKFLYG | | DEEEDLKAES |
VPKPLGSSES | | EVMRQKASSL | | PSSAPAVKLE | | SLEETNPEYA | | KIHDLLKTIG |
LDIGVAEISQ | | LAARTQERLH | | GKKPSLRSSA | | DRRSSVDRYF | | SADHCSSVDH |
RFSADRCSSV | | DHCFSADRRS | | SDPHRLESRE | | AHHSNTHSPE | | VSHPHPPSPV |
DPYLLTKNSP | | PFLKSDHPVG | | HISGPEVVGS | | GFQSSVAVRC | | MLPSAPSAPI |
RLPHTAALSQ | | FHMPRASQFA | | AARIPPNYQG | | PAIPPASFDA | | YRHYMAYAAS |
RWPMYPTSQP | | SNHPVPEPHR | | IMPITKQATR | | SRPNLRVIPT | | VTPDKPKQKE |
SLRGSIPAAQ | | VPVQVSIPSL | | IRYNPEKISD | | EKNRASQKQK | | VIEEREKLKN |
DREARQKKMY | | YLRTELERLH | | KQQGEMLRKK | | RREKDGHKDP | | LLVEVSRLQD |
NIMKDIAELR | | QEAEEAEKKQ | | SELDKVAQIL | | GINIFDKSQK | | SLSDSREPTE |
KPGKAEKSKS | | PEKVSSFSNS | | SSNKESKVNN | | EKFRTKSPKP | | AESPQSATKQ |
LDQPTAAYEY | | YDAGNHWCKD | | CNTICGTMFD | | FFTHMHNKKH | | TQTLDPYNRP |
WASKTQSEAK | | QDAIKRTDKI | | TVPAKGSEFL | | VPISGFYCQL | | CEEFLGDPIS |
GEQHVKGHQH | | NEKYKKYVDE | | NPLYEERRNL | | DRQAGLAVVL | | ETERRRQSEL |
KRKLSEKPKE | | EKKEKKAKAV | | KEVKEDDKVS | | EKLEDQLSEG | | RNSPEKAENK |
RNTGIKLQLK | | EEVKKESPTS | | SSFGKFSWKK | | PEKEEEKSSL | | VTPSISKEEI |
LESSKDKEDG | | KTEAGKAKPI | | KIKLSGKTVV | | AHTSPWMPVV | | TTSTQTKIRP |
NLPIPSTVLR | | KSCSATMSKP | | APLNTFLSIK | | SSGTTAKPLP | | VVKESSADLL |
LPPDIISKAF | | GGEEVILKGS | | PEEKVVLAEK | | SEPSHLPEQI | | LPPPPPPPPP |
PPPPPPVIPH | | PAAPSAAQAN | | AILAPVKSNP | | VVSQTLSPGF | | VGPNILNPVL |
PVAIMASAQP | | AAIPSDETAP | | GVSESDRDQT | | LFSVLVRPPP | | PLSSVFSEQA |
KKLEKRNSCL | | ATANAKDLYD | | IFYSSGGKGA | | PETKGAPETK | | LSGGPLANGE |
NSNLSRTKSS | | DTSSTSPLNS | | SASQEELHQD | | EGLVAAPIVS | | NSEKPIAKTL |
VALGKWSVVE | | HVGPKSTGST | | YGFLQPLTRL | | CQSRPYETIT | | PKTDTLAIWT |
SSSFQSDTSR | | DISPEKSELD | | LGEPGPPGVE | | PPPQLLDIQC | | KESQKLVEIH |
LRESVNQDKE | | SQELRKSEDC | | RESEIETNTE | | LKERVKELSE | | GIVDEGVSTS |
IGPHSIDDSN | | LNHGNRYMWE | | GEVKQPNLLM | | IDKEAEQSNK | | LMTGSETPSK |
VVIKLSPQAC | | SFTKAKLDSF | | LSEARSLLNP | | QDTPVKISAP | | ELLLHSPARS |
AMCLTGSPQE | | QGVSVVSEEG | | LENSAPESAS | | RTSRYRSLKL | | KRERSKDFQV |
KKIYELAVWD | | ENKKRPETWE | | SPEKPKTEAL | | ELQDVHPELT | | VTIESKALED |
FEATDLKVEE | | LTALGNLGDM | | PVDFCTTRVS | | PAHRSPTVLC | | QKVCEENSVS |
PIGCNSSDPA | | DFEPIPSFSG | | FPLDSPKTLV | | LDFETEGERN | | SPNPRSVRIP |
SPNILKTGLT | | ENVDRGLGGL | | EGTHQALDLL | | AGGMMPEEVK | | ESSQLDKQES |
LGLELKTINS | | AGLGPSPCLP | | DLVDFVTRTS | | GVQKDKLCSP | | LSEPGDPSKC |
SSLELGPLQL | | EISNASTTEV | | AILQVDDDSG | | DPLNLVKAPV | | SRSPPREQVI |
EDNMVPQGMP | | EQETTVGAIQ | | DHTESSVHN |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Zinc finger protein 318 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13578 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5VUA4 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|